由科技部委託台灣大學主持的第1期「能源國家型計畫」，近期爆發論文抄襲醜聞。據傳參與本次計畫的辦公室研究助理呂錫民竊用抄襲，就連台大教授暨計畫執行長陳發林等學者，也都遭冒名共列作者，嚴重違反學術倫理。而陳發林雖然第一時間將呂錫民解聘，並撤下涉及抄襲的論文，但仍遭美國Retraction Watch（撤銷論文觀測站）公布此次事件，讓台灣醜聞丟臉丟到國際。
根據《自由時報》報導，由科技部與經濟部等跨部會所主辦的能源國家型研究計畫，總共耗時5年、耗資200多億。然而這樣龐大的計劃，卻傳出論文抄襲醜聞。該計畫的總主持人為前台大校長李嗣涔，陳發林為執行長，科技部委請台大成立國家計畫辦公室，負責協調管理與考核研究計畫進度與績效。而涉及抄襲論文的呂錫民，是陳發林的大學同窗，陳在2008年聘請呂擔任台大研究員，並出任該計畫的研究助理，負責相關資料的彙整。不料在2013年，陳發林接獲學生通知，指稱呂錫民將所收集來的資料、研究成果，東拼西湊後並掛上自己的名字，而後更將陳發林在內的數名學者同列作者，投稿國際期刊。
教育部：典範應重塑 將與科技部共商改善之方
事情爆發後，陳發林也隨即向李嗣涔報告，並由律師提告侵犯著作權、姓名權等，後在該年11月和解，要求呂錫民簽下承諾書，不追究民、刑事責任。而科技部目前已成立學術倫理調查委員會調查。 （相關報導： 論文抄襲 科技部初審前教長蔣偉寧停權3年 ｜ 更多文章 ）
教育部長吳思華接受採訪時被問及相關問題時表示，學界一直被詬病太過重視數量，典範應該重塑，但這不是單一學校可做到的事，教育部會協助各校重新自我定位，以集體力量改變典範，翻轉過去的陋習。並且指出，這件事對於台灣學術界的聲譽有一定程度影響，日後將會與科技部合作，想出改善之方。
