新冠Omicron變種病毒4月大舉入侵台灣，中央疫情指揮中心決定讓餐廳維持正常營運，中研院院士、生物醫學科學研究所所長郭沛恩指出，「這個決定我相當支持，這顯示主管機關接受，與病毒共存；此時，其他法規限制就失去作用。」「相較於兩年半前，現在疫情完全改觀，所有法規限制的理由都不存在了。」
郭沛恩對台灣的防疫政策相當關切，今年5月初主動寫一封信，透過前副總統陳建仁轉交中央疫情指揮中心，提出多項建言，包括取消所有的法規限制，可惜指揮中心並未採納。他日前接受《風傳媒》專訪時表示，「台灣在疫情初期，表現不錯，但到了第二階段，卻缺乏勇氣遵循科學防疫的原則。」
