隨著武漢肺炎疫情在全球擴散，各國紛紛採取措施，包括撤僑及停飛往返中國航班，防止疫情傳至境內，但義大利也停飛往返台灣航班，我國外交部長吳釗燮今（2）日舉行國際記者會強調，對義大利因「錯誤認知」所做的決定感到遺憾，而義大利會做出此錯誤決定，主因是世界衛生組織的疫情報告中，把台灣列為中國的一部分，更稱世界衛生組織讚揚中國作為「是在哈囉」。
吳釗燮指出，世界衛生組織（WHO）發布的武漢肺炎疫情報告中，把台灣10個確診病例算進中國部分，而義大利衛生部依據WHO的報告提出停飛往返中國班機的建議，所用文字與WHO報告相同。外交部歐洲司長姜森強調，義大利停飛往返台灣航班的決定「未依據科學數據，此決定不正確」，而WHO把中國疫情列為最高警示，又把台灣列為中國一部分，誤導視聽。
「台灣是台灣，台灣不是中華人民共和國（PRC）的一部分，台灣不受中國政府管轄」，吳釗燮強調，台灣與中國各自有獨立且互不隸屬的衛生及民航機構管轄，「這是簡單事實，WHO不應犯錯，呼籲WHO改正對台灣的嚴重錯誤」。他也說，義大利內部對於停飛往返台灣航班也有不同意見，目前仍持續透過管道與義大利交涉，希望義大利更正決定。
至於越南在4小時內改變停飛往返台灣航班的決定，吳釗燮表示，我國透過駐越南代表處及越南駐台灣代表處積極溝通，而越南駐台代表處立即回報正確資訊，加上民航局和航空公司也積極交涉，「這是政府與民間通力合作的成果」。對於中華航空（華航）名稱是否讓他國誤會，而做出停飛往返台灣航班的錯誤決定，吳釗燮持否定態度，重申WHO把台灣列為中國的一部分才是主因。
吳釗燮也痛批，WHO總幹事譚德塞（TedrosAdhanomGhebreyesus）及突發事件執行主任萊恩（Mike Ryan），誇讚中國防疫作為「是在哈囉」，但仍直言會持續推動參與WHO等國際組織的目標，因為就算我國防疫體制完善，也有友好國家協助，但在取得最新資訊上仍不夠即時，「這對2300萬台灣人民不公平，也對能夠獲得台灣幫助的國家不公平」。 （相關報導： 武漢肺炎風暴》科學家：這種新型病毒非常狡猾，會率先攻擊人體深處肺泡！ ｜ 更多文章 ）
對於WHO聲稱我國在技術層面有合作，外交部國際組織司長陳錦龍直批，「此說法不正確，且誤導國際視聽」，並指出2009至2019年間，我國總計提出申請參加187場技術性會議，最後僅獲准與會57場，「許可率約30%，否決率高達70%」。他還說，我國疾病管制署透過程序，向WHO回報確診病例，卻一直未能到即時有效資訊，「影響整體防疫作業」。
