新任總統當選人蔡英文批評馬政府想在520政府交接前強推「新世代高教藍圖計畫」，因為其關係到５年千億的預算，若強行通過，是對未來新政府的不尊重，對此，民進黨籍立委鄭麗君等8名教育文化委員會立委在今天（24日）中午拜會教育部長吳思華。鄭麗君表示，吳思華已承諾在教委會未通過前，「新世代高教藍圖計畫」不會進行政院核定，表示該計畫將會暫緩實施。
總統當選人蔡英文在昨天（23日）到南港軟體科技園區拜會生技產業，她在受訪時提到，她有注意到跨年度的重大預算政策以及其執行的問題，她特別指出，目前執政的政府有一項橫跨五年，耗資千億的高教藍圖計畫，原本預定明年執行，但是現在的政府卻希望在520前核定，對此，蔡英文認為對未來的政府不夠尊重也不恰當。
民進黨籍立委鄭麗君表示，該計畫關係鉅額公帑，經費分配也有質疑聲浪，教育部更不該在看守期間強推新的高教政策，期望教育部尊重新政府與新民意，而新政府也將重新擬定高教政策的參考，因此行政院應該暫緩核定。
五年計畫已經超過一屆總統的任期，綠營立委也希望投資高等教育以及提升大學素質，但是過去10年投入的資源應先進行整體的檢視及討論，而非繼續投入資源，並建議新政府在高教政策與教育資源分配的政策上，必須傾聽社會上的民意，並做整體檢討；鄭麗君說，高等教育是台灣人才培育非常重要的一環，如何做到整體思考與分配經費預算是新政府負責任的做法，而雖然綠營在立院占有人數優勢，但是不會藉此廢止該計畫，而是會在會期中與各界討論，同時也建議新政府編列一年的過渡預算，以避免衝擊目前大學的需求。
而對於教育部的正面回應，鄭麗君也表示這正是雙方的正面互動，也是吳思華給新政府的正面回應；而教育部長吳思華今天除了局部回應高教藍圖外，也希望交接條例盡快立法，並且表示在該法訂定前會加強溝通以確保責任政治的運作。
