總統馬英九自評馬習會成果「設定的目標大致都達成了」，然而其行前設定的推動建立兩岸領導人會面常態化機制的溝通平台，會後定案為陸委會與國台辦之間的「熱線」。之所以結果較預期目標為低，據透露，係因在會前磋商中，對岸表示須視實際晤談的情況而定，我方幕僚也建議馬英九，第一次會面談此議題，不宜將層級設定太高，最終晤談中確定循序漸進，由陸委會主委和國台辦主任之間的熱線先行著手。
熱線功能 設定緊急事態聯絡處置
儘管熱線設在部會首長層級，但兩岸對熱線功能的設定為「緊急事態聯絡處置」，雙方首長一旦透過熱線溝通，訊息直接回報層峰，例如我方就是由陸委會主委直接回報國安會及兩岸外交小組，並直通總統，針對「緊急事態」下達指令，已具備「準互信機制」的功能，符合馬英九不久前研擬定案之《台海和平倡議》構想。
馬習會後，兩岸在各自的國際記者會上宣佈，雙方在晤談中同意設置「熱線」，用以加強「即時溝通」，「管控矛盾分歧」，層級則設定為陸委會主委和國台辦主任。
然而馬英九在會前設定的目標，此次馬習會是為推動未來兩岸領導人會面常態化，建立溝通機制。在行前的國際記者會上，馬英九也透露出在既有的陸委會與國台辦平台之外，「不排除提高溝通機制的層級」。
原本設定國安會層級 但對岸態度保留
據透露，馬英九原本設定的目標，是希望將此一溝通機制設置在國安會層級，以利未來協商提升至領導人熱線。但在與對岸磋商議題內容時，對岸態度傾向保留，並未接受此一提議，回應視晤談情況再做決定。
我方幕僚也向馬英九建議，兩岸領導人初次會面，雙方又首次討談此一議題，「不宜一下子談得太高」，建議以強化並提升陸委會與國台辦管道的功能著手。在正式晤談中，雙方遂同意循序漸進，將現階段陸委會與國台辦的業務局處溝通平台，及副主委層級直接聯繫機制，升高為陸委會主委與國台辦主任間的熱線。
據我方與談人士透露，雖然陸委會主委夏立言與國台辦張志軍早已是兩岸溝通重要窗口，「但既然公開宣佈設置熱線，就已經是某種政治性宣示」。
根據我方規劃及馬習會晤談結果，兩岸事務主管首長間的熱線，主要功能在於「緊急事態聯絡處置」。知情官員舉例，熱線建立後，若台海發生第三方武力進入、類似中美軍機擦撞等意外，或者各自在內政或涉外面臨緊急事態，雙方可立即透過熱線說明並定義「緊急事態」，直接通報或溝通作法。參與晤談作業的人士直指，此一機制已接近「準互信機制」。
不同於目前副主委層級平台的事務性質，兩岸事務首長熱線背後即為彼此的國安小組與領導人。以我方為例，夏立言與張志軍在熱線溝通後，訊息直接回報國安會及外交兩岸小組，並直達馬英九；反之當然也可以在層峰指示下，透過熱線向對岸傳達訊息。 （相關報導： 國台辦消極 習近平下令：馬習會辦不成就人頭落地 ｜ 更多文章 ）
台美事務納通報？官員未否認
據參與研擬及磋商的官員透露，此一機制設計意在緊急事件發生時，供兩岸決策高層直接溝通，避免誤解，確定以和平方式解決爭端。至於台美之間曾針對太平島以「人道援助」名義，在美軍需要時提供後勤支援一事達成共識，未來是否也會納入「熱線」通報範圍？官員未予以否認，僅表示此為假設性問題，但將會向美方充分說明磋商及晤談內容。
