教育部27日駁回台大校長遴選結果，而教育部長吳茂昆今（30）日又發言指出，從沒干預大學自主，也沒有政治考量。前總統馬英九今天出席2018「新世代最嚮往企業Top 20」頒獎典禮，針對管中閔案表示痛心，批評教育部違法濫權，打擊台大校長當選人管中閔，還踐踏制度、傷害價值。
吳茂昆今天說，從沒有干預大學自主，也沒有政治考量。他說，台大校長是遴選不是選舉，《大學法》也規定國立大學校長由教育部聘用，教育部當然可以檢視其是否適合和正當性，教育部有權力替人民把關。
對此，馬英九今天批評教育部違法濫權，馬英九說他身為台大校友，感到非常痛心，也認為整個事件發展的非常離譜。
馬英九說，《大學法》的主要精神一個是大學自治，一個是依法行政，兩個都被踐踏，「這是全體國人的課題，不只是台大而已。」
學術沒有真正的民主？馬回：別再硬拗
而對於吳茂昆說學術沒有真正的民主，馬英九認為如果再這樣硬拗下去的話，台灣真沒有前途了，「而且政府裡面這麼多台大校友，他們怎麼做得出來？」
媒體繼續問道，是否認為蔡政府會以政治力介入校園，馬英九說，「對，真的是沒辦法想像他們會做這樣的事情」。
馬英九強調，教育部的做法打擊的不只是管中閔一人，而是踐踏整個制度、傷害價值，他覺得這是最不可原諒的一點。
