在全球疫苗荒、各種新冠疫苗效力又不相同的情況下，部分國家與醫師同意或建議開放「混打疫苗」，不過日前遭到衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）否決，維持不同廠牌的新冠疫苗「原則不建議交替使用」。不過德國政府證實，已在4月份接種AZ疫苗的總理梅克爾，前幾天接種的第二劑正是美國致贈台灣的莫德納疫苗。
中央流行疫情指揮中心專家諮詢小組召集人張上淳21日表示，雖然國際間確實有少數混打新冠疫苗論文，但混打個案數非常少，且個案皆是第1劑接種AZ疫苗，第2劑混打BNT疫苗，目前沒有任何資料顯示AZ疫苗混打莫德納疫苗可能造成哪些影響。張上淳強調，雖然莫德納疫苗及BNT疫苗都是mRNA疫苗，但2種疫苗是不同廠家製造，不可直接做為參考依據。
Kanzlerin #Merkel: „Ich freue mich, dass ich heute die Erstimpfung mit AstraZeneca bekommen habe. Ich danke allen, die sich in der Impfkampagne engagieren – und allen, die sich impfen lassen. Das Impfen ist der Schlüssel, um die Pandemie zu überwinden.“ pic.twitter.com/P4kMJYNrlc
— Steffen Seibert (@RegSprecher) April 16, 2021
不過德國政府發言人22日表示，梅克爾（Angela Merkel）前幾天完成了她個人的第二劑新冠疫苗注射。梅克爾雖然在4月份接種了AZ疫苗，但這次她接種第二劑的卻是莫德納。然而報導這項消息的英國廣播公司（BBC）也說，即便部分專家認為混打疫苗可能是個好主意，不過現在下結論還為之過早。
AZ疫苗今年稍早曾在歐洲陸續傳出血栓案例，讓包括德國在內的多個歐洲國家暫停施打。德國後來雖然開放使用，但也將年齡限制在60歲以上的老年人，4月份更開放對所有成年人使用，66歲的梅克爾也在4月份完成第一劑接種，並且隨即在網路上貼出她的疫苗接種卡，希望促使國民趕緊前往施打新冠疫苗。
根據羅伯特・科赫研究所22日公布的數據，目前已有51.2%的德國人口（約4250萬人）至少接種了一劑新冠疫苗，接種兩劑的則有31.6%（約2630萬人）。
BBC指出，雖然新冠疫苗混打的好壞目前在學界尚無定論，但在英國的一項研究指出，在混打AZ與輝瑞BNT兩種疫苗後，成年人一般只會出現輕度至中度的副作用；路透則指出，目前已有多國允許混打疫苗，因為疫苗供應短缺的緣故，希望早日提高（兩劑）疫苗對國民的保護性。
此外，由於AZ疫苗出貨的不確定性（像是印度生產的AZ均已停止出口）、加上AZ疫苗的血栓疑慮，加拿大的安大略省和魁北克省都正在考慮開放混打疫苗。魁北克省省長弗朗索瓦・萊戈特（Francois Legault）21日表示:「我們的公共衛生部門告訴我們，兩劑新冠疫苗打不打同一個廠牌都可以。就算是混打，其好處也是利遠大於弊。」。 （相關報導： 非洲抗疫》世衛助南非研發mRNA新冠疫苗，9到12個月內將可量產 ｜ 更多文章 ）
BBC引述支持混打疫苗的醫療專家說法，他們認為混用兩劑疫苗可能讓接種者新冠病毒（甚至變種新冠病毒）產生更廣泛持久的免疫力，也為疫苗的普及提供更大的靈活性。德國則是在開放對所有成年人接種AZ、並且在年輕族群中出現少數血栓個案後，建議已經接種AZ疫苗的60歲以下國民，應該要混用不同疫苗，預防血栓狀況發生。梅克爾的年齡雖然已經超過60歲，但她也選擇了AZ以外的莫德納疫苗。
