總統蔡英文將於5月20日開始第二任總統任期，屆時準副總統賴清德也將正式上任副手一職，不過這段期間，賴清德公開露面的時間並不多，從近期現身的畫面可見，他將頭髮剪短展現新氣象，看起來年輕許多。
賴清德7日與台南市長黃偉哲、總統府秘書長陳菊、強方科技董事長方旭強、台灣杜邦董事長陳俊達、經濟部工業局長呂正華、經發局長陳凱凌等人一同出席強方科技新廠動土典禮，外界也發現他將頭髮剪短，與以往造型不同。
據指出，賴清德處事嚴謹，對自己的外表儀容亦是如此，因此在上任副手前重新打理髮型、將頭髮剪短，也隱含突破、改變、全新開始的意義。
在新冠肺炎（武漢肺炎）疫情延燒之際，雖然賴清德擁有公衛專家身份，但他從疫情爆發以來一直維持低調風格。據了解，主因為當初疫情升溫時，賴清德曾在1月底深夜於臉書發文表示，「呼籲中國應該持開放的態度接受國際援助，台灣也應該義不容辭參與，協助中國解決這個嚴重的疫情，不致讓疫情持續擴大。」結果這番話意外遭到外界抨擊，也讓個性嚴謹的他因此「嚇到」，此後他幾乎不再對外發言，僅在偶有的公開活動中，稱讚政府防疫佳績。
賴清德後來在臉書發表關於防疫的文章，只有與交通部討論紓困補助計畫，以及分析台灣是否要因疫情封城的2則貼文而已。據了解，因為疫情緣故，賴清德近期不僅沒有什麼公開行程外，私底下也只有一些拜訪行程，目前大致為交接工作進行準備，並以留在台南為主。
賴清德上任後，蔡英文將會交付何種任務也備受外界好奇。據指出，蔡英文剛親自宣布，將持續推動總統府原住民族歷史正義與轉型正義委員會（簡稱原轉會），因此相關工作預計會由賴清德分擔。
蔡英文2016年5月20日上任後，就在8月1日的「原住民族日」代表政府向原住民族道歉，並成立原住民族歷史正義與轉型正義委員會，「第二屆原轉會」日前舉行最後一次會議時，蔡英文也宣布，第三屆將繼續進行。
過去賴清德在擔任台南市長時，就力推西拉雅族正名運動，甚至將西拉雅族列為市定原住民。後來台南市政府頒台南文化獎給長期致力於西拉雅文化和語言復興，以及推動西拉雅正名運動的新化九層嶺部落萬正雄長老的活動時，時任行政院長賴清德也親自出席。
在2016年的原住民族日，蔡英文曾透過演說代表政府向原住民道歉，當天還是台南市長的賴清德也在臉書發文表示，「近年來，我們和族人致力爭取正名，雖然困難重重，但大家並不氣餒，今天蔡總統向原住民道歉，也強調是和解的開始，我們希望透過西拉雅族正名，恢復歷史，才能達到反省的目的。」可見他長期關注原住民族議題。
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