近日進口雞蛋因圖利廠商、蛋品標示有誤，以及未來流向等爭議延燒，農業部長陳吉仲於19日晚間宣布請辭。對此，前台南縣長蘇煥智表示，陳吉仲「留下太多爛攤子」，更列舉市場公平競爭機制、進口數量與時程、傷害雞農，以及食安等爭議進行譴責。此外，他更喊話政府，要「自我節制」扮演好遊戲規則制定者，並堅守裁判的角色，不應同時扮演球員兼裁判。
蘇煥智今（21）日於臉書大批陳吉仲「留下進口太多的爛攤子」指出，專案進口鷄蛋風波不斷延燒，陳吉仲在9月17日提出辭職但被慰留，顯然民進黨府院黨步調不一，情勢上實在非常難看。表面上行政院院長陳建仁要陳吉仲說清楚講明白，實際上是總統蔡英文及總統候選人賴清德之間的權力跛腳化的矛盾，及「英系」與「新系」的利益衝突。
專案進口政府採購模式 扭曲了市場機制
蘇煥智表示，專案進口鷄蛋的執行者，財團法人中央畜產會董事長，同時為前農業部主委，也是新系成員之一的林聰賢一併提出辭呈，兩人共同進退，雖然下台但問題仍無解，專案進口蛋的難堪及貪污圖利責任爭議卻仍未停歇，而隨著極端氣候變遷加劇，禽流感每年愈演愈烈，每年2、3月以後缺蛋危機恐成常態化，所以如何因應的缺蛋危機的對策，其實非常重要，如果只停留揭弊究責，對國會過半的執政黨恐怕也是停留在狗吠火車，「官官相護而人民無可奈何」。
蘇煥智說明，鷄蛋是基本民生必需品，本來民間就可以自由進口，只是關稅高達30%。所以一旦國內鷄蛋生產短缺，造成鷄蛋價格上漲1倍、2倍或3倍時，應該考慮增加國內蛋的供給，以平抑物價；可以考慮立法授權，或依憲法緊急命令，由政府於限定期限內取消關稅及進口後第一次交易營業稅，以增加貿易商進口鷄蛋誘因，必要時並得採取鷄蛋「逐顆補貼一定金額」的模式，尊重市場公平競爭的機制。
針對陳吉仲專案進口政府採購的模式，蘇煥智認為，「基本上就是扭曲市場機制。」說明同樣都是進口商，受農業部委託的不但有補助，而且又有中央畜產會專買，根本不必擔心通路問題。但其他的進口商則沒有得到補助，而且要自己尋找通路，顯然立足點並不平等。
蘇煥智更直言，由於陳吉仲與林聰賢採取專案進口政府採購的模式，導致衍生如進口量太多、專案進口時間太長、傷害雞農等惡果，由於專案委託進口政府採購，結果採購量太多，高達1億4071萬顆鷄蛋，加上民間自行進口自用或出售者，造成專案進口量太多，導致5100萬顆蛋因超過安全保存期限而必須銷毀，且增加2億多元的支出，以及太多專案進口蛋，導致中央畜產會被迫拜託蛋商幫忙賣蛋，甚至進入做冷凍殺菌液蛋，而進入食品加工系統，非常浪費國庫。
