從新冠危機一開始，北京種種隱瞞訊息、要吹哨者閉嘴、發布假數據、阻止外界調查的作為罄竹難書。只要注意北京在初期處理危機的方式，就可以看出其手法非常粗魯，而且是故意造成外界誤解和混淆，讓世界各國無法反應，在剛開始幾個星期讓情況迅速惡化。
中國當局是在十二月三十一日首次向WHO通報武漢有不知名的肺炎在流傳，但他們說「這種病是可防可控的」。同一天，台灣官員也向WHO通報武漢有「非典型肺炎」的病例，並說中國衛生部門表示這應該不是SARS。也是在同一天，中國社群媒體審查員開始在中國網路上刪除「武漢不知名肺炎」、「SARS變種」、「武漢海鮮巿場」等名詞，以及任何批評政府反應的言論。但中國官員還是默不作聲。第二天，武漢醫師李文亮被公安局傳訊，要他為言論不實和擾亂公共秩序簽名道歉，因為他在微信社群提醒其他七名醫師要注意新型的類SARS病毒。
政府最初的說法是，新病毒是源於武漢的華南海鮮市場，因為最初一些病例和那裡有關連。當局很早就認定這種說法，但這種說法既無法被證明，也無法被否定。初期確實有跡象顯示，當疫情爆發的公開訊息還被掩蓋時，武漢官員就把注意力放在華南市場。一月一日，武漢市政府完全清空和消毒華南海鮮市場，但沒有從動物或工作者身上採集任何血液或體液樣本，這表示病毒起於市場的任何證據都被消滅殆盡。中國研究人員後來在知名醫學雜誌《刺胳針》上發表的研究指出，最早在十二月一日確診的病例，以及最初群聚感染中的三分之一病例，都和華南市場沒有關連，病毒不太可能來自那裡。
北京一開始就說海鮮市場是爆發的源頭，同時又確保後來的調查者根本無法證明或否定。
中國當局後來又透露，世界頂尖的蝙蝠病毒研究機構武漢病毒研究所在一月二日就完成基因定序。他們從樣本看出這個病毒是類SARS冠狀病毒，這表示他們在處理一種高危險、高傳染力和未知的病毒。
病毒基因序對圍堵傳播和著手開發治療方案至關重要，但中國當局卻在病毒散播時坐擁這些重要資料。一月五日，上海公共衛生臨床中心也通報中國政府，已經成功對新病毒做完基因定序。政府卻阻止臨床中心對外分享資料。六天後，研究人員不顧命令，逕自對外發布。該實驗室隨後就被關閉「糾正」。
WHO從一開始就在思量北京關於病毒的說法。一月十四日，WHO推文說，「根據中國政府的初步調查，中國武漢的新型冠狀病毒（2019-nCov）沒有發現人傳人的現象。」 （相關報導： 「台灣是重要貿易夥伴，但不會承認其國家地位」中歐高級別戰略對話，歐盟對台灣問題表態 ｜ 更多文章 ）
據報導，同一天，國家衛健委主任馬曉偉在和各省官員的內部視訊會議中表示，這個病毒是「2003年SARS以來最嚴重的挑戰」。接下來六天，北京沒有和中國政府之外的任何人溝通。與此同時，幾千萬中國人正在進行農曆新年的全國大春運，包括武漢，加速疫情爆發。WHO官員直到一月二十一日才被允許進入武漢，發現確實有人傳人的現象，證實了北京專家小組的首席科學家鍾南山在前一天的說法。然而，WHO仍然沒有發布此為「國際關注公衛緊急事件」。兩天後，中國當局完全封鎖武漢。一月三十日，IHR緊急委員會（WHO的一個單位）還發聲明稱讚中國政府「致力於透明性」。二月三日，WHO秘書長譚德塞稱讚中國的防疫策略，稱讚北京防止了更多病例爆發。
