準台北市長柯文哲自當選以來，為了落實選前承諾的「開放政府，全民參與」理念，不少局處首長採公開遴選與iVoting的方式選出，也因為過程不盡理想引起不少爭議，使許多市政顧問、遴選委員不滿而掛冠求去，除6名原住民市政委員外，目前共15名已請辭表示抗議，以下是請辭名單與請辭過程。
12月11日
兆豐金控工會理事長吳世哲原本就是遴選委員，引發外界質疑「球員兼裁判」。吳世哲11日出示3日的辭職證明表示，他參選時就已辭職，但這起「裁判變球員」的事件仍難平輿論，吳世哲下午2點45分在柯辦幹部李應元陪同下召開記者會，正式宣布退出勞動局長遴選。
12月12日
師大地理系教授汪明輝、歐蜜‧偉浪、原住民族政策協會理事長伍杜‧米將、作家高振蕙（利格拉勒‧阿鄔）、蕭世暉、金惠雯等6名原民委員會市政顧問，不滿未被重視，表示「我們將考慮公開辭去市政顧問職務」，目前則尚未正式提出請辭。
12月16日
柯文哲市府的文化局長傳選出音樂人倪重華之後，引發幾位市政顧問不滿，包括視覺藝術聯盟榮譽理事長胡永芬、盜火劇團藝術總監謝東寧、前公視總經理馮賢賢及身兼遴選委員的詩人鴻鴻，均表示請辭市政顧問一職。
12月17日
繼胡永芬、謝東寧、馮賢賢與鴻鴻之後，鴻鴻在臉書代遴選委員之一、前國家文化藝術基金會執行長蘇昭英發佈訊息指出，蘇昭英也正式辭去市政顧問一職。
12月18日
柯團隊否決環保局長遴選委員會推薦的3位人選，並且取消i-Voting，另外找來現郝市府的翡翠水庫管理局長劉銘龍掌環保局，引起遴委兼市政顧問詹順貴不滿，宣布請辭。
12月19日
社會局長人選由許立民出線後遭質疑欠缺社工背景，前副市長白秀雄、老福盟秘書長吳玉琴、台少盟秘書長葉大華、殘盟秘書長王榮璋、台大社工系教授林萬億、社工師公會理事長滕西華等6人更直接請辭市政顧問，向市民道歉，並痛批柯文哲讓醫療壟斷社福。
12月19日
柯團隊宣布資訊局長將由前逢甲大學資訊長李維斌出任。身為資訊局長遴選委員之一的1985行動聯盟發起人、前台大醫師柳林瑋，在臉書表示對結果相當滿意，並宣布請辭遴選委員一職，不過柳林瑋的辭職與其他人不同，他於臉書表示「選的人都出來了，現在請辭應該沒差吧」，他表示提出辭職就是個搞笑的說法而已。
