前教育部長蔣偉寧因被捲入國際期刊論文審查舞弊案而下台，中研院院長翁啟惠認為，論文上只要掛名，就代表對於這份論文有所貢獻，理應為這份論文負責，「雖然整起事件的內情如何還不清楚仍有待查明，但蔣偉寧請辭就是負責的表現。」
中研院院長翁啟惠16日中午受邀出席三三會午餐會並發表專題演講，對於前教育部長蔣偉寧捲入論文舞弊案而請辭，翁啟惠表示不是很清楚整起事件的始末，《震動與控制期刊》（JVC）撤銷的5篇論文的問題，並非抄襲或造假，而是審查過程出現弊端，「我覺得台灣可能太重視論文發表，忽視性質不同的大學或學校特性，僅以論文發表篇數為最主要升等或評估的標準，整個評鑑方式都要檢討，因為不同性質學校的各種評鑑方式比重應該要不同。」
翁啟惠進一步指出，學者的學術貢獻，不應該只限於論文發表，包括在該領域的影響力、培養人才出路等等都是評估點，論文發表應該僅是其中之一，發表之後如何影響領域發展、甚至被邀請出席國際重要性演講或是國際大獎殊榮肯定學者在該領域貢獻，尤其對於社會工作的經濟影響力都是不可忽視的評鑑標準，「論文只是評鑑學術貢獻的指標而非目標，錯把指標當目標，就失去學術研究最重要的目的。」
記者追問，蔣偉寧公布「國際震動及控制期刊（JVC）」回函，強調自己雖然掛名但其實是無辜受害者，是否認為蔣請辭有些委屈或是認為這是蔣應負起的責任？對此，翁啟惠認為：「一旦掛名就代表在整個實驗工作、對於整份論文是有所貢獻，所以掛名不是壞事，但是一掛名就代表要為這份論文負責，蔣部長為此請辭就是為這件事情負責，至於內情如何、審查過程有什麼問題，可能要釐清之後，外界才能夠知道是怎麼一回事。」
