在多份民調優勢下，年底大選，民進黨內普扁認為林佳龍出戰的台中市拿下機會很高，唯據了解，雖然林在多份民調對尋求連任的國民黨市長胡志強都佔上風，但林跟舊台中縣新潮流系統的整合，仍有嚴重問題。林在公開場合逕自宣布要「任用」初選對手蔡其昌為「發言人」，用因怨離開新潮流的前中常委方昇茂任總幹事，都讓新系火大。
林跟新系的互動不佳，視台中市為「准勝不准敗」的黨中央也很頭痛。
跟新系互動不佳「林佳龍從沒專程拜訪過蔡」
一位中部新潮流人士說，林佳龍初選過關後，除了和蔡其昌在立院碰面，蔡和林有番「看看需要我幫什麼」的客套互動外，從沒專程來拜訪過蔡，也沒就任何選舉安排跟蔡討論過，但蔡基於黨內團結考量，依然出席1月底的團結造勢活動，結果林當場竟直接「任命」蔡，說要由蔡任「發言人」，現場聽到的人都驚嘆不已。
林佳龍和新潮流恩怨甚深，據了解，當年林佳龍選台中市長，林陣營公布胡志強病歷，本來還想找時任立委的台南市長賴清德幫忙公布，卻被賴推拒，就讓新系對林很防備；而林稍後被游錫堃拔擢，擔任黨秘書長，任內發生排藍民調、解散派系，11寇鬥爭等清算新系事件，更讓新系從上到下都跟林結下深仇大恨。
新系在台中市無法奈何林，但縣市整併後，對林要選大台中，在台中縣深耕多年的新系則是堅壁清野，上次推蘇嘉全應戰，這次由蔡其昌倉促上陣落敗，而林在台中縣也只和反新力量互動合作，雙方關係如同水火。
一通簡訊「請你幫忙海線」新系氣結
新系人士透露，各界普知林佳龍和新潮流的深怨，曾有蔡的友人在初選過後直接問過蔡其昌，「如果林找你當總幹事，你要怎辦？」蔡則回「還真的不知該怎辦？」想不到，當天林竟能「任命」蔡任「發言人」，現場人士一陣譁然後，事後方昇茂又一通簡訊給蔡「請你幫忙海線」，更讓新潮流「倒彈」。
這位人士直言，林佳龍的態度很清楚，就是林擺明認為他穩贏，已經穩上台中市長，甚至已經遙望2020 ，要和賴清德拚未來了，根本不需要新潮流協助，所以不需要找長年在台中經營的老利（新潮流總幹事，台中縣新系大老）、邱太三、蔡其昌等人，但這樣新系反而樂得輕鬆，大家都不用尷尬，不像其實也不爽林的前秘書長蘇嘉全，因為要考量小英的黨主席和總統局，還必須忍著情緒賣力幫林。新潮流人士抱怨，從政也多年的林竟能「不按牌理出牌到如此」「這已無關政治，而是最基本為人處事的問題。」
孤傲林佳龍 立院教委會召委不敵學妹鄭麗君
對照林佳龍本屆終入立法院，問政表現相當積極，但孤傲個性仍在，一直在教育委員會的林曾想當召委，卻不敵台大學妹鄭麗君。蔡其昌雖屬黨內「顧人怨」的新潮流，但在立院人和頗佳，任書記長、幹事長，也鮮少以黨內派系立場行事，此次初選，20多位跨派系綠委現身力挺，更讓2人在黨內人望清楚對比，一位過去屬扁系的資深立委私下就坦言，對比蔡其昌，林佳龍人緣真的有夠差。
對相關說法，蔡其昌僅說，他不考量任何職位，只要林佳龍有任何需要，他都會幫忙。
林佳龍目前和幾位親近的台中市議員在首爾、仁川作市政考察，預定下週才返台，對新系人士及黨內質疑，林僅透過幕僚表示，他相信黨內仍會團結一致，其他質疑內容，他不予置評。
