本次中研院院長遴選過程，修改計票規則引發風波。前中研院院長李遠哲，今天（21日）在中研院院長交接典禮上，說了一段當初他擔任院長期間，有同仁在中研院的內部刊物，抱怨餐廳對院長與一般同仁「大小眼」的故事，他以此期勉新任院長廖俊智，「當院長要有寬容胸懷，讓人家冤枉一些沒關係」。
李遠哲說，他20年前接受中研院聘任擔任院長，當時年紀比廖俊智還年輕1歲，當時他到中研院各院所訪問，1位年輕學者剛從美國名校回來，當面嗆李遠哲，說院長都是來當官的，當下雖然覺得「這年輕人怎麼這麼沒禮貌」，但他不以為意，後來他積極推動院內改革，把原本中研院發行的公報，變成院裡同仁交流的周報，沒想到1年之後，中研院周報出現了1篇名為雙魚記的文章，抱怨中研院餐廳對待院長跟一般同仁態度「大小眼」。
李遠哲說，他跟太太有一天在中研院餐聽點菜，送來了1隻魚，因為2個人吃不了這麼多，他順手切一半給了鄰桌，鄰桌吃了大為驚豔，幾天後他自己來餐廳，又點了魚來吃，吃了很失望，懷疑餐廳把好吃的魚給院長。
李遠哲說，他進餐廳，會問餐廳老闆，「今天有新鮮的魚進來嗎？」老闆回答，有剛打撈起的南部鱸魚，那位發表雙魚記的同仁，做錯了1件事，「他沒有問今天有沒有新鮮的魚」。
李遠哲說，這個故事他在心裡藏了20年，藉著院長交接典禮機會，他期勉新任院長，要有寬容胸懷，「讓人家冤枉一些沒關係」。
