民進黨立院黨團14日舉行記者會指出，台灣21世紀基金會與中國的農業科學院等單位成立兩岸農業研究單位，讓中國抄襲台灣農業技術。民進黨團書記長陳亭妃表示，該基金會發起人就是國民黨總統候選人朱立倫岳父高育仁，她質疑，朱立倫同意這樣的買辦政策，將台灣的農業優勢讓渡給中國嗎？
對此，21世紀基金會今晚發布聲明表示，基金會是公益性質的非營利團體，依法未從事任何投資行為，更未出資成立「海峽現代農業研究院」，遑論出賣台灣優良農作物品種給中國，這樣的指控純屬子虛烏有。
民進黨立院黨團表示近日取得一份2013年2月由台灣21世紀基金會舉辦的「海峽兩岸現代高峰論壇」會議資料，資料中揭露台灣21世紀基金會早在2013年甚至更早前，即主導將台灣農業技術的平台與中國簽約成立研究中心，讓中國抄襲台灣農業技術。
民進黨立委段宜康表示，4年前根據中國媒體報導，高育仁的「21世紀基金會」和中國農業科學院、福建省農業科學院合資，成立了「海峽現代農業研究院」，朱立倫的妻舅高思博擔任理事，而研究院的任務是「引入台灣優良種子資源」。段宜康質疑高育仁主導出賣台灣的優良農作物品種。
陳亭妃說，將台灣的中藥和農業以平台方式輸出，根本就是兩岸農業經濟和技術的買辦，如果把台灣的農業技術往中國輸出，還在當地成立研究中心，中國若日後模仿台灣的農業技術，台灣農業將不再具有優勢。
但21世紀基金會反駁指出，段宜康未經查證就引用中國大陸媒體報導在臉書轉述，是子虛烏有的不實指控。基金會沒有農業技術或相關專利，何來違法輸出農技？段宜康和民進黨立法院黨團記者會所言，實屬無稽。
21世紀基金會表示，日後如果有任何人再假借前述事由，以訛傳訛、惡意散播或引述不實謠言而損害基金會或相關人士信譽，必依法追訴一切民、刑事法律責任，絕不寬貸。
