台北市長柯文哲上任清查前市府爭議案件，總統馬英九日前接受媒體專訪時宣稱，美河市案由副市長決行，不了解詳情，但實際上，柯市府日前清查日勝生取得的7件北市府捷運站開發案，其中有4件高度爭議案是在馬英九擔任台北市長期間確定由日勝生開發，包括台北車站特定專用區交9案、文湖線木柵站交13案、新店機廠美河市案和南港機廠案等，馬市府割地賠款式的與財團開發方式明顯損害市民權益，當時的市府大家長馬英九也難辭其咎。
台北市長柯文哲在3月19日召開日勝生專案報告會議，會中全面清查日勝生與台北市府合作的捷運站開發案，赫然發現其中高度爭議案件均是在馬市府時敲定，使得原本實收資本額只有18億的「日勝生活科技股份有限公司」，得以拿下北市府規格最大的三大捷運開發案，瞬間從小蝦米變成大鯨魚。
4爭議案中，新店機廠美河市案在2001年12月簽約、2006年取得建照；台北車站特定專用區交9案在2004年12月簽約、2005年12月取得建照；文湖線木柵站交13案在2005年7月簽約，南港機廠案則是日勝生在2005年11月取得第一順位申請資格，開發案均在馬英九擔任台北市長期間決定由日勝生集團開發。
契約放水 投資權轉讓鑽漏洞
實際上，柯文哲上任後於今年1月初就已指示北市府政風處重新清查日勝生歷年參與捷運局土地開發案相關案件，總計7案，政風處調查發現，因市府的投資契約中並未明訂允許投資團隊變更及變更須符合的相關條件和程序，前市府官員大開方便之門，讓日勝生取得鑽漏洞的巧門，日勝生及其子公司屢屢透過變更增加聯營人或合作人等方式，取得實質投資權，如木柵站和永春站的取得開發權，形式上雖只是合作團隊成員變更，但實質上卻是涉及投資權轉讓轉售，使原投資團隊成員可以免於被市府沒收履約保證金就可退出投資，更有機會藉投資權轉售而獲利，而原本無法參與投資的廠商也可透過此一方向間接取得投資權。
前市府團隊不只在投資契約中以未明載變更投資團隊成員規定的方式，大開方便之門，也在日勝生的投資開發案中，疑有未確實依徵選須知規定檢附相關資格證明文件，但市府官員卻放行情事，除了新店機廠案，其他6個開發案均有此一爭議。其中在台北車站特定專用區的交9案中，依招標文件規定，「單一公司投標者或企業聯盟投標者之任一成員於最近10年內須有以投資或開發大型不動產或類似設定地上權案例之相關經驗等」，但當時日勝生資格預審時所提出的資格證明文件是以「台北都會區大眾捷運系統新店線新店機廠用地聯合開發投資契約書」，為證明文件 ，但當時新店機廠案根本尚未開工，是否符合實績極具爭議。
存款轉存 製造虛假財力證明
另在交9案中，當時台北市議員徐佳青亦曾提出檢舉，指日勝生在進行「財務能力」資格審查時，提出銀行存款餘額證明時，疑有利用一筆或數筆資金於不同銀行、不同帳戶間轉存製造存款證明的不正當手法，實際上，整個交9案正是在馬英九任市長時評定投資廠商，確定開發案並簽約、興建的。
在南港機廠案，日勝生也採取了類似手法，在馬市府時代，日勝生集團於2005年11月取得「南港機廠案」的第一投資順位投資人資格，2006年1月5日市府秘書長陳裕璋在回覆捷運局的南投機廠開發案公文時裁示，「日勝公司承接多件大型聯開案件，現行財務結構能否支撐，有無充實必要，請再檢討」。但實際上，北市府仍未取消日勝生的資格，任由開發案審核長達一年，直至日勝生募足新台幣8億元及12億元之現金增資，郝龍斌接任市長後，於2007年1月雙方才完成簽約，日勝生安全上壘。
