在舊版房地合一稅推行時，巢運雖認為仍有改善的空間，但基本上肯定財政部的立法方向。而財政部長張盛和之後向行政院報告的房地合一稅版本，卻令巢運傻眼。
巢運痛批，「單一稅率17%根本是劫貧濟富！」由於一般受薪者工作所得適用5%到45%的累進稅率，年所得只要超過117萬，稅率就從20%起跳，但獲利超過上千萬、上億的炒房卻只課17%，明顯對一般受薪階級不公平。
而房屋持有2年以上的減徵獎勵也是巢運批判的重點。巢運認為，2年以上就算長期持有是投機客的邏輯，合理作法應是持有2年內加重稅率，持有2到10年者採一般稅率，持有10年以上才給予優惠稅率。
此外，為避免衝擊過大，新版房地合一傳出將有實施前5年交易的房地產才依實價課稅的「日出條款」，巢運認為既已制定長期持有優惠並扣抵土地增值稅，政府不應自我設限。
除了對新版的批評外，巢運過去也認為實價課稅應納入預售屋，否則根本就是抓小放大。
