根據民航局最新統計，復航空難最新死亡人數為31人，仍有12名旅客待搜救。由於機上有31名陸客，中國將協助調查，這也是台灣空難首次有中國失事調查機構參與。飛航安全調查委員會執行長王興中說，根據國際民航公約規定，失事客機旅客國籍國家，有權參與失事調查。
多名中國旅客在復興空難中罹難，飛安會證實，中國方面將依國際民航慣例參與事故調查。行政院發言人孫立群表示，中方依國際慣例參與調查，不涉及主權問題，將由陸委會與相關單位協調進行。
飛安員會5日上午表示，因失事班機上有31名中國乘客，中方已提出將參與調查，這也是台灣空難調查首次有中方機構參與。飛安會表示，根據國際民航公約規定，失事客機旅客國籍國家，有權要求參與事故調查。
交通部在5日上午的行政院會報告空難處理情況時並未報告此事。針對兩岸共同調查一事，是否可能涉及司法等相關管轄權問題，孫立群在會後記者會並未直接回答管轄權問題，但強調中方依國際慣例提出要求，因此不涉及主權問題，後續將由陸委會及相關單位協調進行。
而行政院方面則補充說明，根據飛航事故調查的國際慣例，失事飛機主權國、罹難乘客國籍國，及飛機生產國均有權參與調查，是國際間處理飛安事故的標準程序。
此外，政院方面也表示，兩岸已洽談《兩岸飛航安全及適航標準合作協議》，雖然尚未簽署協議，但已有基本架構，應該可以依此架構進行協調。
飛航安全調查委員會4日下午已取得黑盒子，包括座艙語音通話紀錄器（CVR）與飛行紀錄器（FDR），最快希望6日可以判讀出初步結果。交通部同時宣布，國內同型機共22架停飛，通過特檢後才能再飛行。復興航空去年7月23日也曾發生1架ATR72-500型飛機，從高雄飛馬公時，墜毀在馬公機場外，造成48人死亡的重大空難。5日失事的ATR72-600型飛機是由法國製造，發動機由加拿大製造，飛安會也已聯絡法國失事調查局（BEA）、加拿大運輸安全委員會（TSB）共同參與調查。法國失事調查局人員5日下午會到台灣，加拿大運輸安全委員會人員預定6日抵達台灣。
而受到寒流影響，加上水氣多降雨，復興航空墜河搜救現場又濕又冷，增加救援的難度。搜救團隊今天清晨調度生命探測儀器，以及金屬探測儀器，軍方則出動工兵協助搭建浮門橋，當成浮動碼頭與棧道。目前已經打撈出的飛機，尾部比較完整，中間疑似還有其他的客艙仍在尋找。軍方也出動蛙人部隊，會同消防潛水人員一起打撈剩下的殘骸。根據民航局派駐前進指揮中心人員上午回報，「機頭已經被壓扁與貨艙、客艙都擠壓在一起，現場客機已經變形，看不出來完整性。」民航局表示，截至今天上午9時的統計，空難死亡人數31人，死者遺體暫分別安置在第一、第二殯儀館及仁本禮儀公司；傷者15人，分別送往內湖三總3名、忠孝醫院3名、松山空總3名、汐止國泰醫院2名、台北醫學院2名及台安醫院1名接受治療；另1位旅客已出院。目前12名旅客仍待搜救，2名地面傷者仍在醫院救治。復興航空已開始安排專人發放緊急慰問金每人新台幣20萬元（含2位地面傷者），截至目前已發放9人，發放作業陸續進行。復興航空今天將針對已確認身分的罹難者家屬，另發放新台幣120萬元喪葬補助費，供家屬運用於喪葬相關支出。
