朱立倫掌國民黨後，即將面對最大挑戰─2016的總統與立委選舉。為借重立法院長王金平的力量，如何處理敏感的王金平黨籍案備受外界矚目。朱立倫已在中常會上指示考紀會，儘速研擬出健全方案，避免考紀制度因撤訴而崩盤。黨內人士指出，朱立倫雖緩辦，但時間並不站在國民黨這邊，若不儘速解決王的官司案，一旦拖到三審判決出來，對國民黨又是一記當頭棒喝。
目前國民黨因為訴訟代理人變更，暫時可以用程序「凍」住三審判決的進程，不過，法院發函提醒國民黨要表明是否承接訴訟，一旦承接，三審就會繼續進行，若遲未表明，法院也不可能永無止境等待，很可能以程序不合法為由駁回上訴。
九合一敗選後，馬英九請辭負責，但對於王金平的黨籍官司仍是念茲在茲，朱立倫表明「家和萬事興」，但也未明確表達對王案的處理方式。21日中常會上，中常委串連撤訴，挺馬的中常委謝龍介獨排眾議，直言「家和萬事興」也要包括馬英九。
事實上，國民黨在黨籍案已2連敗，但仍決定上訴的理由已經很清楚，並非針對王金平個人，而是為了避免黨內考紀制度崩潰，以維繫政黨政治正常運作。朱立倫上任後的首次中常會，立刻指示考紀會著手處理健全考紀制度一事。
黨內人士說，考紀制度具有民意基礎，才不會再發生類似許舒博與王金平等的黨籍爭議，而一旦健全考紀制度之後，國民黨「被迫」上訴的理由消失，撤訴自然就可水到渠成。黨內人士說，此作法一來可以解決王金平黨籍爭議，二來又可以兼顧馬英九的面子，應是各方能接受的最大公約數。
黨內人士說，國民黨提出新的考紀制度之後，王金平的黨籍不會自動恢復，因此，仍必須針對過去已開鍘的黨員有通案性的處理，例如讓不符民意基礎的黨紀處分自始無效等，再向最高法院提出撤訴，否則，王金平的黨籍仍無法解決。
