對許多民進黨的支持者，尤其是較年輕的1450，對郭正亮的印象可能是常常在偏藍的政論節目「唱反調」，在兩岸關係立場上是在泛綠陣營中「政治不正確」的親中派。
不過應該很多人都不知道、或不記得，1999年陳水扁代表民進黨競選2000年總統，在當時已經決定不競選連任的總統李登輝，在德國媒體訪問時發表「兩岸是特殊的國與國關係」的〈特殊兩國論〉，其他陣營總統候選人都被迫對兩岸關係做出表態，而代表陳水扁陣營選定「兩個華人國家」立場撰寫說帖的，就是郭正亮。而這篇刊登於1999年7月15日的文章，內容就是《新新聞》專訪郭正亮以了解扁陣營對兩岸關係的詮釋思路。
郭正亮在訪問中表示：「短期內，看起來國民黨向民進黨靠攏（發表〈特殊兩國論〉），對民進黨有利，但是北京入局後，對民進黨就不利了，對連戰有利了。」簡單說〈特殊兩國論〉讓國民黨看起來像是民進黨的跟隨者，等於幫民進黨背書，但北京若介入批判李登輝，引發的反感會回饋給連戰陣營。對於「北京怒批」的輔選力看得相當透徹。
