日本九州地區近日飽受豪雨侵襲，受災最嚴重的熊本縣截至6日傍晚已傳來44死的消息。蔡英文總統5日分別以中文與日文在推特上表示慰問，短短24小時已有2.5萬人轉推、9.9萬人按讚，這則消息甚至登上NHK的熱門國際新聞，日本網友除了紛紛留言「日台友好」，甚至有不少人對安倍政府敲碗，希望能以國賓的身份正式邀請蔡英文訪問日本。
熊本縣由於河川氾濫與嚴重土石流，截至6日傍晚至少已有44人死亡、1人心肺停止、10人行蹤不明。由於交通受阻，還有許多地方無法掌握正確災情，目前包括警察、消防隊與自衛隊都在冒雨進行搜救。蔡英文總統5日以中日雙語傳達關心與慰問之意，表示「連日暴雨造成九州地區嚴重洪災，我得知熊本縣的老人安養中心『千壽園』因為淹水造成多人死亡，對此我深感遺憾。在此向逝者祈福，並衷心期盼災情早日恢復原狀」。
蔡英文也以中文表示「極端氣候對生命造成的傷害不分地區，連日嚴重豪雨不僅對中國長江流域帶來災害，也在日本九州地區造成傷亡。我們希望天候能回復正常，為逝者祈福的同時，也盼希望受損的家園能早日重建，傷者盡速復原」。蔡英文的中文推特有1.4萬人按讚、兩千多人轉推，日文推特更是廣受好評。這件事經過日本放送協會（NHK）報導後，迅速登上熱門國際新聞，日本網友轉發推特時更紛紛表示「謝謝台灣」、「台灣真朋友」、「每次發生事情都是台灣最先發聲援助日本」，還有不少網友希望安倍政府邀請蔡英文訪日，與日前自民黨決議不可邀請習近平以國賓身份訪日，恰好形成鮮明對比。
對於蔡總統的慰問，日本首相安倍晉三6日也以中文撰寫推文表示感謝。安倍在中文的推特中表示：「致台灣的朋友們：俗話說『患難見真情』。在九州地區發生豪雨災害之際收到溫馨的慰問，本人心中充滿了感激之情，謝謝各位。」日本台灣交流協會代表泉裕泰也在官方臉書發文，表示「蔡英文總統對九州地方豪雨災情的慰問留言日本收到了。蔡總統於2016年4月熊本縣發生地震時，作為準總統迅速表明與日本同在的心意。蔡總統一直以來都掛心日本，日本總是受到蔡總統的鼓舞。台灣對我國而言是共享基本價值、並有著緊密經濟關係與人員往來的極重要夥伴、同時亦為重要的友人。今後期望日台也能共同攜手度過難關，持續並肩前行。」
