復興航空GE2322班機，4日在金門尚義機場等候起飛，在尚未接收塔台指示時，便逕自進入跑道。立榮航空B78809班機當時正準備降落，所幸塔台管制員即時發現，並指示立榮航班立即重飛，才化解了復航又一次險因重大疏失所造成的災難。
違規的復航GE2322航班，是ATR72-500機型，當天載有3名旅客與4名機組員；而準備降落的立榮航班，則載有71位旅客與4位機組員。
據了解，當時因復航機師未獲起飛許可而逕赴跑道，與已獲降落許可的立榮航班有可能發生事故。立榮航班當時僅距機場約5浬，飛行高度約1500呎，估算約於2分半內就會降落於跑道。塔台管制員即時發現跑道仍有「障礙物」，隨即取消立榮航班的降落許可。立榮航空表示，該班機確有重飛事實，但細節不予多談。
民航局表示，根據調查，復航在進入滑行道前，確有向塔台航管人員申請滑行許可，而塔台管制員告知有航班準備降落，請復航班機滑行至跑道停等線等待。此時機師看到另一架復航客機落地，在該機脫離跑道後，違規駕駛在未獲管制員發出許可指令的情況下就駛入跑道。
據機上座艙語音通話紀錄器顯示，正駕駛在看到另一架復航班機降落後，一度懷疑是否已接獲起飛許可。但正駕駛未向塔台確認，反而向副駕駛詢問是否已接獲起飛通知，副駕駛回應已獲許可。
民航局事後表示，就當時立榮航班的距離和高度來講，是還有足夠的時間予以應變的。民航局進一步解釋，機師通常在最後的進場階段，必須目視到跑道才能落地，若看到跑道有其他航機，機師也會立即重飛；加上層層的防範機制，違規事件不易發展為2機對撞或追撞的意外。
復航：持續推動飛安精進改善計畫
復興航空表示，正副駕駛皆為資深機師，但卻未能精確執行塔台管制人員的指令，讓飛機提前進入跑道，在第一時間已將2位駕駛處以停飛並主動向民航局呈報，將在民航局完成裁量後，不排除開除2位機師。復興航空進一步表示，會持續推動「飛安精進改善計畫」，對外邀請世界飛安基金會來台協助訓練，以及接受民航局的督核；對內則由復航集團飛安委員會稽查與督導所有飛安措施，務求建立「飛安第一」的企業文化。 （相關報導： 復航空難報告》GE235系統錯誤 飛安會：本不應飛 ｜ 更多文章 ）
民航局則說明，復興航空機師因未遵照標準作業程序，違反航管指示，照例應懲處違規機師。但鑒於機師主動向公司通報後，復航立即上呈民航局，因此不會予以撤照，初步研擬將開罰6至30萬元，或要求停止執業1到3個月。
