北農群聚感染事件延燒，台北市長柯文哲稱有一半的確診來自新北、基隆。惹得基隆市長林右昌在23日強調，北農確診照理應由北市進行匡列，但卻是基隆市府自行疫調後才發現，批柯文哲根本「睜眼說瞎話」。對此，台北市政府發言人陳智菡23日回應，根據中央規定，疫調權限本就在居住地的地方政府，「身為地方首長要搞清楚狀況，有幾分證據說幾分話。」
林右昌23日針對北農感染事件再次回應，疾管署6月12日公布的案12609、案12699，經基隆市政府疫調後得知是北農員工。林右昌強調，照道理這2個確診案例，應先由台北市進行詳細疫調，並匡列篩檢，但實際上卻是確診後，基隆做完詳細疫調，才發現他們是北農的員工，直指「柯市長是睜著眼睛說瞎話」。
對此台北市政府發言人陳智菡則反擊，疫調權限本就歸屬居住地的地方政府，這2例確診都居住在基隆，林右昌卻說台北要先做疫調後進行匡列，「難道是不清楚疫調規則，還在狀況外嗎？」
且基隆做完疫調上傳後，疾管署也未立即通知台北市政府，是北市府擴大清查後才得知的資料，這也凸顯了北市一直強調「跨縣市疫調」的問題。陳智菡強調，目前傳染源仍不明，怎能斷定就是在北農群聚感染？「身為首長，最好有幾分證據說幾分話。」
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