新冠肺炎（武漢肺炎）疫情嚴峻，先前協調機組員居家檢疫時間縮短為「3+11」的民進黨立委范雲備受質疑，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中29日則表示決策由他負責。不過，資深媒體人黃光芹指出，陳時中去年3月就曾召開會議，容許航空公司可中斷機組員居家檢疫，安排繼續服勤。
陳時中28日在立法院曾表示，該會議是由副指揮官陳宗彥主持，不過陳時中29日改口表示，經他查閱資料，陳宗彥沒有參加那場會議，該會議是由疫情監測組、邊境檢疫組、社區防疫組、醫療應變組及專家討論，討論後向他面報，第二天就以新聞稿發布相關措施，「所有的這些相關在指揮中心的政策，都是由我來負責」。
對此，黃光芹在臉書表示，從去年到今年，一直是陳時中的決定，2020年3月18日，陳時中召開「第三次會議」，修訂「國籍航空公司機組人員防疫健康管理措施作業原則」，附帶但書，容許航空公司可中斷機組員居家檢疫，安排繼續服勤。而陳時中今年4月26日則曾表示，「原本降成5天時，居家檢疫期間可以派飛，管理上容易混淆，才改成3天。」
黃光芹也提到，今年5月12日，中央流行疫情指揮中心專家小組諮詢委員李秉穎曾說，過去指揮中心將特殊族群檢疫天數縮短為5天、7天等，專家小組都心軟同意，但學理上來說，新冠病毒的潛伏期是14天，病毒不會因為工作需要，潛伏期就變成7天。
最後黃光芹指出，陳時中今年5月15日更曾說，「就算檢疫5天，可能還是很難驗出病毒，但延長到檢疫7天，就非常困難；延長到14天，華航大概就要倒了。」
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