馬英九總統28日首度就前陸委會副主委張顯耀洩密案表示立場，肯定陸委會主委王郁琦處置明快正確，「沒有必要去職」。他更要求外界不要再對案情多做揣測，「請大家放心，這絕對不是政治鬥爭」。
總統府28日舉行媒體茶敘，馬英九在回應記者提問時，正式表達張顯耀案對政局及兩岸關係的衝擊表示看法。對於外界質疑王郁琦處理不當，應負政治責任而下台，馬英九更明白表示，王郁琦處置正確，「沒有必要去職」。
馬英九說，發生這種事，不能假裝沒有看到，也不能包庇、不能縱容；王郁琦對此案主動發現、主動調查、明快處置、聯繫檢調、配合偵辦，並且主動出面說明，記者會開了70分鐘，「全世界政府很少花這麼多時間說明一件事」。
對於在野黨抨擊此案說明國安機制失靈，馬英九說，國安機制並沒有問題，相反地，王郁琦接觸這類訊息後便主動調查、明快處置、配合偵辦、對外說明，證明「國安機制沒有失靈，而且有反省能力」，王郁琦的作法是正確的，任何類似的狀況都應該這樣處理。
外界質疑張顯耀案為內部鬥爭，馬英九也強調，「請大家放心，這不是政治鬥爭，我們自己的同仁怎麼會去鬥爭他呢？」但是當他涉嫌犯罪時也不應包庇或掩護，這是從事公務最起碼的態度；若同仁涉及違法，必須要面對、要追查，但為顧及他的人權，也要給他充分發言的機會。
馬英九表示，陸委會不是調查機關，在有懷疑時配合檢調深入調查，檢方調查也還在進行中，這時候做太多揣測，並不是正確的，也希望社會各界及媒體，暫時停止沒有依據的揣測，讓檢調機關有純淨的空間把此案調查清楚。
馬英九說，他當然知道全國人民，包括對岸對此案都非常關心，希望知道結果，但要讓最後結果能禁得起考驗，一定要檢調機關非常深入且確實的調查，一定要做到勿枉勿縱。他表示，雖然此時無法告訴大家張顯耀涉了哪些嫌、做了哪些事，但未來一定可以真相大白、水落石出，讓大家正確地評斷。
