部桃疫情緊張之際，澎湖、苗栗、雲林、金門、連江等五縣市發布「禁桃令」，呼籲民眾不要前往桃園出差、洽公。
禁桃令引發重大爭議，鄭文燦說，其實國民黨籍雲林縣長張麗善曾打電話給他，解釋自己並沒有禁桃，只是希望雲林的國中小學畢業旅行盡量往中南部走而已，卻被講成是「禁桃令」，她「覺得很抱歉」。
除了張麗善，國民黨籍苗栗縣長徐耀昌也致電鄭文燦，說他是講希望到外縣市洽公能多用電話、網路，不是說要「禁桃」，徐稱自己被記者誤導，也對此事造成桃園困擾，感到抱歉。
在防疫這件事上，不乏藍營諸侯與桃園同陣線。部桃確定進入社區感染後，鄭文燦宣布停辦桃園燈會、新春團拜。同一時間，各地方縣市首長也在傷腦筋這些事。
