中共人民大會28日表決通過，將制定「港版國安法」，也讓香港自由民主受到嚴重威脅。總統蔡英文1周內2度表態，使用了2次《香港澳門關係條例》。執行的陸委會在28日也明確定義，政府將以《港澳條例》第18條「援助條款」及第60條「暫停適用條款」雙軌並行，同時兼顧國安及人道。
相關黨政人士指出，面對香港一國兩制的倒退，台灣必須同時兼顧國安及人道，這是蔡英文1周之內，先在臉書上提到《港澳條例》第60條，以及在公開場合宣布組成援助港人專案小組的原因。
「台灣是否在政治上仍視香港為第三地？」
相關人士指出，一般輿論可能只留意到《港澳條例》第18條可援助受政治因素陷入緊急狀況的香港人，但事實上整部《港澳條例》定義台灣與港澳不同於兩岸的關係，授權比兩岸間更大的自由空間，若北京透過港版國安法堂而皇之地把手伸入香港，那麼原本《港澳條例》所授權的自由空間，恐出現國家安全破口，這是第60條的保護機制。
陸委會主委陳明通28日以「兩條腿」來形容政府目前因應香港情勢的作法，以《港澳條例》第18條及第60條「雙軌」並行，分別面對港人及中共伸入香港自治的手。而蔡英文與行政院長蘇貞昌討論之後，拍板成立的援助港人小組，就是基於條例的18條，「兩條腿走路，一方面撐香港人民，一方面建構國安防衛網」。
陳明通說明，基於當年中共的「一國兩制」承諾給予香港高度自治，《港澳條例》授權我方將香港視為中國以外的第三地，與港府、港人、香港民間組織、企業或機構互動，而不同於《兩岸人民關係條例》的重重限制。一旦香港政府在法律上已被視為執行北京意志，而北京意志代表著併吞統一台灣、消滅中華民國，我方必須在《港澳條例》機制中有所回應，啟動國安防衛機制。
陳明通質疑，「港版國安法」若上路實施，港府執行的仍是港府的意志？或是已成為北京意志？台灣的國安機制就必須審慎評估，「是否在政治上仍視香港為第三地」。
事實上，攤開《港澳條例》審視第60條啟動的要件，「香港或澳門情況發生變化，致本條例之施行有危害台灣地區安全之虞時」。此條在1995年立法時就已明訂，而當初立法說明中，即表示此條文的機制，在於避免港澳地區「獨立之司法制度」遭受破壞，即「保護條款」。
有在野黨及民團喊出要修正《港澳條例》第18條，包括時代力量黨團、民眾黨團及國民黨立委陳以信提出修正草案，盼在原有「協助因政治因素受緊急危害的港澳居民」條款中，再明確修訂庇護程序。
不過綠營學者、台灣智庫諮詢委員董立文日前於民進黨中執會報告時提到，他認在野黨所提出的修正草案，看似強化《港澳條例》第18條的機制，但實際上寫越多、規定越詳細，反而越多限縮。
具中常委身分的民進黨立委張宏陸以同樣主張質詢陸委會，陳明通也大表贊同，認為原有條文已有相當寬鬆空間，包括總統所宣示，政院所組成的跨部會人道救援小組，就是依據第18條的空間處理，尤其在《施行細則》中也規定有需要援助個案情形，報請行政院專案處理，現行空間已足夠。
不過陸委會定調的「第60條保護」、「第18條援助」雙軌制，民進黨立委江永昌則提出不同意見。江永昌質疑，我方目的是在香港發生狀況時，「要對人民放寬、同時又要對港府限縮」，但矛盾的是，整部《港澳條例》其實只有第60條有對上香港政府的意義，前面的所有條文都是有關人民、交通、金融、交流及經貿等民間活動，恐怕真要拿第60條對抗制衡的效果有限。
