國內H5N6禽流感疫情持續延燒，為鼓勵禽鳥業者主動通報疫情，農委會原要參考2015年爆發疫情作法，確診染新型病毒後的撲殺，採評價全額補償。不過現在另有考量，擔憂業者因此不做防疫。
2015年爆發的禽流感疫情，全國鵝隻幾乎全數撲殺。當時農委會為了鼓勵業者主動通報疫情，檢驗確診染新病毒需作撲殺的業者，能獲得的撲殺補償為評價後的全額。防檢局指出，依照現行制度，主動通報確診禽流感疫情要做撲殺，會給予業者評價的6成做為補償。然而，若是將補償提高到評價的全額，就是連採市價銷售的利潤都算進去，擔心業者會因此不做防疫。
而也有畜產業禽類專家表示，2015年做的全額補償，是因為當年多達6個鹼基的3種新型高病原性禽流感爆發時，國內業界還沒什麼人使用有利防疫的密閉式禽場設施，全額補償是為了鼓勵通報，以利防疫快速、全面展開。他認為，補償評價的6成已是成本補償，不需要再做全額補償。
農委會則表示，獎勵水平將會高於規定的6成，但不會到全額，目前擬採8成，尚待農委會主委林聰賢定案，最快今天，最慢明天確定。
