檢方本周起將就MG149專戶中的「私帳」部分款項明細展開調查，台大醫院葉克膜小組組長蔡壁如和經手該帳戶的醫務秘書劉如意都將協助偵辦，知情人士透露，私帳的各筆款項進出，劉如意均記錄得極為詳細，帳目非常清楚，不過，因劉如意從未想過私帳帳目會攤在媒體前，甚至成為呈堂證供，因此她對於私帳每筆款項的來源或支出註記，極有個人風格，如葉克膜團隊出國演講費等，劉多註記為「廠商捐款」，個人演講收入就記錄為「個人捐款」，很容易引起外界誤解，如今只能靠她在偵訊時逐筆向檢方說明了。
知情人士指出，MG149專戶成員以團隊名義承接的研究案，先由委託單位將研究款項匯入台大402專戶，再轉匯至MG149專戶的帳號中，負責經手MG149帳戶款項作帳的劉如意，會將該筆款項以紙上作業方式歸入「公帳」中；若是以個人名義申請研究案，同樣的，委託單位先匯入台大402專戶後再轉至MG149帳戶的帳號中，但劉如意會將該筆款項以紙上作業歸入申請到研究案的該成員「個別帳」；另外，有廠商捐款要取得捐款單據，亦是匯入台大402專戶後，再以指定捐款方式匯到MG149帳戶中歸入個別帳；另由團隊成員個人接受廠商委託的臨床研究案，則以五五分帳方式部分屬個人，部分歸入公帳中。
在MG149專戶中，無論是公帳或是個別帳的款項相關進出，均由台大402專戶轉入，一律納入台大醫院的會計制度中層層簽核，MG149專戶的團隊成員要動支公帳或個別帳戶款項，由團隊成員提出申請，帳戶的名義管理人柯文哲簽字後，還要向上層簽報，須再經過9個章、9道關卡的簽核，包括最高層的台大醫院院長簽章同意，才能動用。
至於MG149專戶的私帳部分，同樣是由劉如意經辦，屬於團隊成員的互助金性質，因此以劉如意的名義開立帳戶。該部分收入除了每月固定會員每人4千或1千元互助金外，就是團隊成員自行捐入的演講費或是葉克膜小組的演講、操作加技術指導費用了，該部分收入，劉如意作帳時均註記為「廠商捐款」、「個人捐款」，此亦成為此次選戰中柯文哲遭檢舉涉嫌貪瀆、洗錢的癥結所在。不過，知情人士指出，幸好劉如意作帳極為仔細，該部分款項的廠商或個別團體的邀請演講資料或行程紀錄，劉如意均有保存。
此外，在私帳中，還有部分款項收入註記為「國科會計畫」或其他研究單位計畫，此亦是柯文哲遭指控挪用計畫經費至私帳中證據，但知情人士指出，其實此為政府研究單位或計畫經費不足，或是經費尚未核撥，因此MG149專戶團隊成員申請由私帳的款項先行代墊，之後再歸還；或是研究計畫的經費不足直接從私帳的款項中提供、補足，則劉如意就將該部分款項註定為「某某計畫」了。
私帳中每筆帳目收支均由劉如意逐筆經手、記錄，蔡壁如則負責每月核對管帳，因此檢方要想釐清MG149專戶的私帳問題，恐怕得耐著性子逐一比對了。
