台北地檢署檢察官9月25日上午10時許傳喚台大醫院葉克膜小組組長蔡壁如以證人身分訊問後，隨後於11時許與蔡壁如前往台大醫院調閱MG149帳戶的相關檔案、單據資料及電腦，檢方將在本周再次傳喚蔡壁如，及負責管處理帳目的醫務秘書劉如意，共同解讀說明MG149帳戶中有關「私帳」部分的所有收支明細，待檢方釐清MG149帳戶的私帳內容後，將就其中疑點及爭議傳訊無黨籍台北市長參選人柯文哲進一步說明。距離年底縣市長選舉投票日只剩下短短2個月，此時檢方大動作辦案引發外界高度關注，MG149帳戶案儼然已成台北市長選戰最後階段的攻防主調。
國民黨立委羅淑蕾於9月10日指控由柯文哲設置的「台大外科加護病房醫療經費專戶」MG149帳戶有弊，柯文哲涉嫌貪瀆，台北地檢署隨即以「他字案」立案偵辦。檢方已於9月18、19日密集傳訊過取得台大外科加護病房設備、耗材採購案的多家廠商，以及隸屬MG149帳戶的台大醫師成員；緊接著蔡壁如與劉如意在台大外科加護病房辦公室內討論 MG149帳戶的談話內容在24日透過媒體報導曝光，因劉如意請假1周，25日檢方僅先傳訊蔡壁如，並由蔡壁如回台大醫院辦公室調閱MG149帳戶的歷年帳冊、單據明細等各項紀錄，以及由劉如 意所操作、處理MG149帳戶的電腦，全數帶回台北地檢署；本周劉如意銷假上班後，檢察官將再傳喚蔡、劉2人就MG149帳戶的「私帳」明細進行判讀和解說。
清查私帳 檢密集約談台大人員及廠商
知情人士指出，2012年爆發大專院校教授涉嫌挪用國科會補助款的「假發票」弊案，2013年也因國科會補助款遭調查局調查，因此有關MG149帳戶的「公帳」、「個別帳」部分，檢調去年偵辦「假發票」案，因清查柯文哲所屬醫療團隊的各項國科會補助計畫，已全數清查並結案；此次羅淑蕾檢舉的則是MG149帳戶中的第3部分「私帳」，即所謂「SICU共同基金」的帳目收支爭議，羅淑蕾主要質疑在MG149帳戶的「私帳」中，竟然有葉克膜等台大醫院設備採購廠商的捐款，因此認為柯文哲有貪瀆之嫌。
MG149帳戶案承辦檢察官蔡偉逸於9月18日當天先後傳訊了多位曾取得柯文哲所隸屬的台大外科加護病房的相關設備標案廠商，了解這些廠商是否曾捐款至MG149帳戶。知情人士透露，檢方當日傳訊的有設備廠商，還有取得耗材標案的廠商，有的曾捐款MG149帳戶，亦有不曾捐款該帳戶者；廠商向檢方表示，台大醫院的採購標案是由台大醫院會計部門統一招標發包作業，而非個別部門自行單一採購，因此相關作業程序，均依照台大醫院的會計制度辦理。
該名人士進一步說明，此次外界關注的台大外科加護病房，並非葉克膜等相關設備及器材的採購標案大戶，因為在台大醫院的發包作業中，外科加護病房均是和心臟外科及一般外科等共三個部門聯合採購設備及耗材，實際上心臟外科和一般外科才是相關設備、器材的採購大戶。
知情人士指出，因採購招標作業由台大醫院的會計部門統一辦理，因此得標廠商的捐款，或是從台大醫院設立的402專戶以「指定捐款」方式捐入MG149帳戶的公帳或個別帳中，至於流入MG149 帳戶的「私帳」者，則是廠商邀請演講、公開操作等方式款項。
