前陸委會副主委張顯耀遭控洩密，黨政人士透露，高層最耿耿於懷的，就是張顯耀向美方及中方洩露我談判底線，而談判底線內容正是來自張於去年8月向國安會調閱的「兩岸互信機制總結報告」。知情人士指出，該份報告內容涵蓋了兩岸互信機制可能談判的各項議題，包括軍事互信機制、兩岸政治協商議題、貿易談判和馬習會可行性等，甚至該份報告中亦討論到民進黨和中國間「民共交流」的利弊等。
知情人士透露，這份由總統核心幕僚、前總統府副秘書長高朗主持的「兩岸互信機制」報告，可說清楚地將馬政府任內可能碰觸的兩岸談判議題均正反面充分討論後，再提出各項議題談判底線建議的完整報告。
其中，高度敏感地自是該份報告中亦討論「馬習會」的可行性，各項評估後仍認為APEC仍是馬習會的最佳會面場域，但因中國方面僅能接受以「會前會」或「會外會」方式，邀請總統馬英九以貴賓身分與習近平會面，不可能以領袖代表身分，因此報告中亦評估，此方案台灣民眾接受度不高。
另報告亦評估於第3地簽署兩岸和平協議可行性，其中對於雙方簽署停戰協議、兩岸和平協議，或是退一步共同發表「和平宣言」模式均有討論，因考量台灣社會氛圍，如何做到對等高度尤其重要，以「大陸地區領導人、台灣地區領導人」互稱，應是我方較能接受的稱謂方式。
又在建立軍事互信機制上，國安會內針對東海、南海及釣魚台等周邊海域均有討論，因兩岸間在金門廈門水域已建立救援演習、打擊犯罪等合作模式，因考量兩岸雙方對釣魚台不屬於日本的防衛態度一致，因此評估在該水域兩岸可能建立合作互動模式。
此外，在服貿、貨貿等貿易談判議題方面，因該份報告於去年完成，其時尚未發生太陽花學運，因此原本依報告中進程，完成服貿協議後，隨即進入貨貿協議談判與簽署，就與會專家學者評估，民進黨應不會阻擋貨貿簽署。
報告中還探討「民共交流」問題，專家學者們認為，面對中方對民進黨的頻頻招手，馬政府要嚴厲防堵民進黨和中國方面建立交流互信的可能，因此馬政府應化被動為主動，與中方多方互動交流，以使兩岸交流的籌碼掌握在國民黨手中。
