地震加上凱米颱風重挫花東，除了觀光旅宿以外，也造成許多交通問題，至今尚有路段在搶修。台鐵北迴線崇德和仁間路線，雖已在8月2日恢復通車，但因小清水溪橋路線中斷，預計年底才能修復，目前採單線雙向行駛，列車誤點頻傳。
台鐵公司指出，現階段和仁=崇德間僅能單線雙向通行，距離長達10.1公里，每列車行車時間由原本5.5分鐘需增至12.5分鐘。不過有民眾反映，假日乘台鐵到花蓮旅遊，北上回程時在崇德站聽見廣播，說明因單線雙向行駛，需等待南下列車先通行，不料一等就是誤點近40分鐘，另有其他班次列車也被卡在崇德站超過半小時，與台鐵說明的12.5分鐘相差甚遠。
台鐵對此回應：「所有行經列車皆需於在崇德站或和仁站等待對向列車到達後再依序開出，致有多輛列車等待及整體行駛時間有所增延的情形。」然而崇德至和仁是宜蘭與花蓮間必經之路，單線雙向通行的情況可能持續到年底才能完成修復，旅客遇到大誤點的形情短時間內可能無法解決。 （相關報導： 觀點投書：北迴鐵路改線及台鐵員工加薪的必要安全改革 ｜ 更多文章 ）
除了部分路段單線行駛，台鐵另縮減、截短許多班次，共計調整278列次，官方資料顯示，其中變動在5分鐘以上班次計189列次(約佔旅客列車21.2%)，不過臨時、非常態性的誤點恐怕才是旅客或居民最擔心的。
台鐵退費相關規則
１．因列車晚點符合賠償標準或營運中斷者，得於事故發生後一年內憑原票申請改乘同等級同區間列車。
２．旅客乘車進站前發現營運中斷或原票所載列車誤點逾三十分鐘，致無法辦理乘車變更時，原票得辦理退票，免收手續費。
３．其他誤點退費原則
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