兩天之內，歹徒放置了4枚炸彈，其中3枚放在三間麥當勞分店，共造成一名員警身亡、兩名麥當勞員工受傷。麥當勞立刻宣布，全台57間麥當勞分店，即日起全部停止營業，避免再給歹徒可乘之機。除麥當勞外，這個炸彈恐懼也蔓延到其他速食店業者，麥當勞的競爭對手肯德基隨後也跟進，宣布暫停營業。
一時間風聲鶴唳，大家聞彈色變，而歹徒卻仍然躲在迷霧中。麥當勞宣布，絕不會與歹徒妥協支付600萬元贖金，反而是要提供懸賞獎金，以600萬贖金的金額加碼雙倍至1200萬元，給提供線索者。警方也同時提供1000萬元的破案獎金，雙方總計2200萬元的獎金，創下當時台灣的破案懸賞獎金金額。
麥當勞爆炸案發生後，警方立刻組成專案小組，大動作地搜捕可疑嫌犯，並透過役男指紋檔案比對、尋找兇嫌──沒想到這起台灣首起以公共場所作為目標的恐怖攻擊的動機，竟然只是歹徒為了籌措結婚基金。除此之外，此案也連帶暴露出許多問題，包括警方對於防爆人員的訓練養成、裝備升級等全部重新規劃。另外，也由於員警楊季章的殉職，使得政府開始重視公務人員因公撫恤，以及警消人員入祀忠烈祠的問題，楊季章也成為第一位進入忠烈祠的警察。
疑犯追蹤
就在兩天內發現4枚炸彈之後，這次換警方出招了，甚至為了避免造成社會更大的恐慌，辦案層級更是拉高至國安局。
當時的專案小組懷疑，這次歹徒所製造的水銀炸彈並非一般簡易的土製炸彈，同時又使用工兵常用的TNT炸藥，研判歹徒具有相關軍事背景，甚至不排除炸藥是由軍中流出，因此將偵辦方向朝向曾受過類似軍事訓練列管者。然而，專案小組並未從軍中爆破專長列管者中找出可疑人士。
好在歹徒在恐嚇信上所遺留的兩枚指紋，還是讓警方找到了蛛絲馬跡。首先警方比對了前科犯的指紋檔案，並未查出符合者。不過，透過當時仍實行的役男指紋建檔資料（民國90年後已取消役男指紋建檔）比對後，從數十萬筆資料中，發現時年29歲、沒有前科的男子陳希杰涉有重嫌。
警方調查陳希杰的背景，發現他是南港高工配管科畢業，服役時是海軍艦艇兵，退伍後曾經賣過茶葉。而此次爆炸案除了炸彈是由茶葉罐作為炸藥容器符合外，照理說他的背景應該不具備製作炸彈的專業知識才對。但由於這是目前已知的線索，因此只能從此繼續追查。
警方鎖定陳希杰犯案後，立刻前往他位於台北縣中和市的住處逮人，但他早就逃跑得不知去向。於是警方在全台撒下重兵搜索，警政高層要求務必盡快逮獲嫌犯，以免人心惶惶。
不敢投案，卻也無處可逃
在全台大搜索的情況下，陳希杰能逃亡的地方有限，加上這次炸死了一名警察，新聞每天鋪天蓋地地報導，因此他也背負著極大的壓力，擔心自己落網後會被判死刑。 （相關報導： 台灣差點就有核武抗中，卻因一場叛逃毀了30年計畫！逃亡美國的他至今堅稱「沒背叛國家」 ｜ 更多文章 ）
案發後，陳希杰一度躲在台北縣新店明潭山區一處廢棄的屋子，沒想到幾天後屋主來了，他連忙跳進附近溪水中逃命。後來，他在逃亡過程中，於5月6日從桃園寄了兩封信，一封寄給媽媽，一封則是寄給警政署長莊亨岱，信中提到他本來只是要錢，炸死警察不是他本意，如今搞出人命也是他始料未及的，他不知要如何表達自己的歉意；同時，他還在給母親的信中稱自己是「罪該萬死的不孝兒」，透露很後悔犯案，自己打算服毒自盡，以了結此事。
