台北市長選戰日益激烈，在歷經資深媒體人周玉蔻的加持下，國民黨台北市長參選人蔣萬安選情看漲，民調回升至40%，北市前副市長黃珊珊也沒閒下來，上周公布競選團隊人事，其中特別強調從綠營挖來醫界與防疫大老郭旭崧，擔任「後援會總會長」一職，看似攻破綠營防疫大門，但國民黨台北市議員參選人楊植斗與詹為元分別指出，郭旭崧過去爭議頗多，包含綠營拔管案當時也被爆出的陽明大學校長遴選爭議，郭旭崧資格不符卻可以參選，以及郭旭崧過去以醫界大老之姿，強烈護航高端疫苗，這些媒體上都有大篇幅報導，楊、詹兩人紛紛批評，黃珊珊不要為了政治利益算計，忽略郭旭崧的爭議過往。
黃珊珊競選團隊發言人李昀臻回應《風傳媒》表示，「我們很敬重郭校長在醫界的名望，希望議員參選人不要為了自己的選舉提一些陳年舊案。」
黃珊珊在9月25日上午於台北市立大學博愛校區中正堂舉行競選總部成立大會，會中宣布邀請柯文哲擔任競總榮譽主委；親民黨前副主席張昭雄及前北市府秘書長張哲揚擔任競總副主委員，政策總顧問為前內政部長李鴻源，特別的是，後援會總會長邀請前陽明大學前校長郭旭崧擔任，策略長則為前北市府顧問翟本喬參與團隊運作。
其中郭旭崧大力支持黃珊珊，郭強調他支持黃珊珊的3個理由是「她最適任、她最適任、她最適任」，也說陳時中雖然這次防疫表現「沒有100分也有80分」，但可以防疫卻不適合當台北市長，應該找最適任的人當市長，由於郭旭崧過去與綠營交好的背景，讓不少媒體報導這是讓人眼睛一亮，跨越黨派的一招好棋。
「郭旭崧爭議多 陽明校長遴選資格不符、護航高端疫苗」
但實際上翻開郭旭崧過去的資訊，其實郭旭崧被媒體公開報導的資訊不少，其中在2018年台大校長遴選案，也就是俗稱的拔管案時，當時藍營除了力挺管中閔之外也主打陽明大選校長遴選更有問題，其中就是郭旭崧只有副教授資格但卻直接被認定為「相當教授」，其中充滿瑕疵。 國民黨松山信義區議員參選人詹為元表示，黃珊珊找來郭旭崧當後援會總會長，一方面是希望借重他醫界的影響力來跟陳時中分庭抗禮，另一方面也是郭旭崧背景相對偏綠，頗有挖民進黨牆角之感。
詹為元指出，但當黃珊珊得意洋洋的覺得這樣跨黨派的後援會是「社會和解」的象徵時，別忘了郭旭崧過去的爭議，除了是陽明大學創校以來第一個以「副教授」身份破格（更精確的說是被護航）擔任校長之外。更嚴重的是郭旭崧在參選陽明大學校長期間，身兼心悅生醫公司獨董職務，而遴委會召集人張鴻仁也是心悅董事。毫不迴避顯示出他視相關規範於無物，對自己並沒有更嚴格的檢視。詹為元說，最後也要奉勸黃珊珊，用人應該要有原則，不要心中只有政治利益的算計得失，而忽略了對方的過往。
除了陽明大學校長遴選爭議外，在過去疫苗採購與國產高端疫苗也屢受質疑與爆發爭議，其中也有郭旭崧的角色，國民黨大安、文山區議員參選人就楊植斗則酸說，黃珊珊不分藍綠都找了人進競選團隊，但連「高端業務員」都能入列，豈不是精神錯亂？ （相關報導： 加註中國才放行！兩岸大打「標籤戰」 學者曝現實面：台灣只有吃虧的份 ｜ 更多文章 ）
楊植斗表示，郭旭崧長期與高端疫苗有連結，2017年時任無任所大使的郭旭崧就曾在台灣研發型生技新藥發展協會（TRPMA）主辦、高端疫苗公司協辦的「登革熱國際防治論壇」 上，推崇高端生技研發中的登革熱疫苗。
