近來爆發新冠肺炎（武漢肺炎）的本土疫情，外界質疑中央流行疫情指揮中心將國籍航空機組員檢疫規定由「5+9」調整為「3+11」所致，監察委員浦忠成及蘇麗瓊更已申請自動調查以究明實情。
指揮官陳時中坦言，疫情爆發1年多來，很多會議沒辦法做成完整會議紀錄，但後來會走公文的程序。他解釋，每天會議實在太多，沒辦法每一樣都做，時常開完會後馬上就要批公文，所以沒要求每一場都要有會議紀錄，但會循著會議紀錄來走公文，行政上不完備請監委見諒。
申請調查的2名監委認為，我國過去1年防疫有成，新冠肺炎在本土僅有零星案例，但國籍航空機組員返國檢疫措施放寬後，本土疫情即大爆發，究放寬檢疫措施與疫情爆發有無關聯？也質疑放寬檢疫措施有無作成會議紀錄？與會單位與人員為何？相關決策過程是否符合《傳染病防治法》、《港埠檢疫規則》等規定？有無相關行政責任？確有深入調查的必要。
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