金九在光復初期的主張，也是希望中美兩國能夠合作，將遺留在東北的關東軍和滿洲國軍組織起來推翻北朝鮮的金日成。南韓的兩個「抗日派」，直到1948年以前都沒有「反美」的問題。日本投降後，雙方的共同敵人反而是主張長久託管朝鮮半島的蘇聯。要等到霍奇將軍妥協，承認自己無法從蘇聯手中奪回北韓，主張大韓民國在38度線以南獨自建國後，金九才與美國分道揚鑣。
當然所謂的分道揚鑣，終極目標也是為了爭權奪利，希望能爭取南韓的右翼民族主義者支持自己，唾棄唯「美國爸爸」馬首是瞻的李承晚。既然霍奇將軍主張永久分隔南北韓，金九的反制作為就是主張南北韓和平統一，並接受金日成邀請前往平壤展開南北韓談判。此舉不只讓美國徹底拋棄金九，也讓他失去了中華民國政府支持。
要知道，當時國共兩軍正在東北大打出手，北韓還暗中為中共的東北野戰軍提供援助，金九此舉違反的不只是美國利益，同時也影響中華民國的戡亂戰局。1948年7月11日，時任中華民國駐韓公使的劉馭萬曾經拜會金九，轉達蔣中正期許金九與李承晚合作反共抗俄的意見。不過此舉仍無法動搖金九反對李承晚政府的決心，中華民國政府決定將他放生。
逐漸失去美國支持的李承晚
到底是誰暗殺金九的？對此當時擔任南韓憲兵司令的張興在回憶錄中表示殺手安斗熙是受國防部長官申性模指示下手的，而美軍陸戰隊出身的米爾利特（Allan R. Millett）上校，則認為真正的幕後元兇是申性模的前任，而且還一度兼任國務總理的李範奭。而且李範奭還在金九被刺殺前一天的1949年6月25日辭去國務總理一職，讓他的嫌疑性更大。
抗戰時在中國出任光復軍參謀長的李範奭，戰後一直以右翼反共領袖的身份追隨李承晚，還組織由「脫北者」組成的西北青年會在社會基層對抗南朝鮮勞動黨的滲透。他對自己的老長官跑到北韓去與金日成把酒言歡，顯然是比李承晚還要更加不能忍受的，才為此痛下殺手。如果李範奭不是幕後指使者，我們也別忘記申性模同樣是日據時代流亡英國的大韓民國臨時政府人馬。
所以刺殺金九的元兇無論是誰，那都是「抗日派」內部的爭權奪利所導致。其實就跟台灣的白色恐怖，一樣是外省人內部的權力鬥爭一樣，並不太涉及「親日派」或者本省人。可是李承晚上台後，大韓民國與美國的關係卻沒有更加改善。先是美軍1949年6月撤出南韓，只留下了500人左右的美軍顧問團協助大韓民國國軍備戰。
李承晚則一如失去大陸後的蔣中正一般，試圖以武力實現南北韓統一，並時常與美軍顧問團團長羅伯斯（William L. Roberts）將軍發生衝突。後來韓戰爆發後，大韓民國國軍在戰場上被朝鮮人民軍打得抱頭鼠竄，更讓美國人懷疑他的領導能力。不過就如艾森豪總統所言，李承晚「是狗娘養的，但是我們的狗娘養的」，他終究還是唯一能團結南韓反共勢力的領袖。
