在復興航空澎湖意外中倖存的傷患，已陸續後送至台北及高雄救治。馬英九總統、行政院長江宜樺及行政院副秘書長蕭家淇，25日下午分別前往台北及高雄的醫院，探視正在治療中的傷患。
馬英九於25日下午1點30分，在交通部長葉匡時及衛福部長邱文達的陪同下抵達台北馬偕醫院，探視受傷的李偉彤小妹妹及其家屬，並致贈慰問金。
馬英九在探視後發表簡短談話，強調政府目前當務之急是救治傷者，並釐清事故原因。
除政院在事發當晚成立應變小組外，馬英九也要求相關單位儘快進行後續工作，包括聯合公祭等也應儘速準備；而後續也應就飛航安全提出具體作為。
總統馬英九慰問在澎湖空難中受傷的李緯彤小妹妹母親姚女士。(總統府提供)
馬英九說，李小妹妹現在仍然插管，無法說話，但意識清楚，情況穩定；醫院認為她可以很快恢復並逐步復原。馬英九更特別感謝在墜機時救出李小妹妹的2名海軍士官，在急難時不忘救助身邊的人。他也感謝澎湖的國軍，在意外發生時全力救援傷患。
馬英九說，台灣已經十多年沒有發生重大空難，希望相關部門能強化飛安措施，更希望台灣以後都能平安。
馬英九隨後轉往林口長庚醫院探視其他傷者；同一時間，江宜樺則前往國軍高雄醫院左營分院，探視傷者李順已及洪郁婷；隨後又轉往高雄榮總，探視傷者許瑀婕。
此外，蕭家淇則代表行政院先後前往高雄醫學院附設中和醫院，探視傷者張智仁，以及在高雄長庚醫院接受治療的顏婉茹及蔡佩儒。
