海軍敦睦艦隊捅出的防疫大樓子，在國防部的緊急切割下，懲處了兩位在第一線海軍艦指部指揮官高嘉賓中將及支隊長陳道輝少將調離現職（拔官），部長嚴德發及海軍司令劉志彬則向總統自請處分。小英也在FB發文與敞廳談話向國人道歉，表示她是三軍統帥，「國軍的事就是我的事」。
這應該是對於海軍聚疫出包最好的警惕，不過，海軍出問題的關鍵不僅僅是防疫上嚴部長所說的四大缺失（疫情通報不夠落實、聯檢小組未落實檢疫、任務期間官兵防疫管理不夠確實、海軍事前防疫措施規劃不足）而已！骨子裡海軍的軍紀與士氣長期以來就陷入低迷，特別是從2016年7月1日雄三飛彈誤射事件，一直到2017年11月22日海軍爆發獵雷艦承包商慶富超貸案，國防部公布了18位海軍高層的懲處案，小英還發表談話，提出三點：
（1）我們會釐清真相，嚴格究辦。
（2）務必要糾正錯誤，解決問題。
（3）政府推動國艦國造的決心，不會改變。
小英當時還強調，「我是三軍統帥，國軍有困難的時候，我一定會一起承擔。」問題是慶富違貸靠得全部都是政商關係而造成的惡果，卻是由海軍來承擔責任。當時對海軍全體將士就是最大的重挫。慶富案沒有下文，而國艦國造同樣不見更新的進度。
如今處理敦睦艦隊防疫出包事件，讓我們又看到類似的處理獵雷艦手法，同樣的小英又對這個大樓子提出三點說法：
（1）海軍因任務讓國人承擔疫情風險，我要致上歉意。
（2）國防部要快速釐清真相、改正錯誤，完整調查清楚後，我不會護短。
（3）面對當前的台海情勢，我已要求國軍堅守崗位，保持正常戰力，國防與防疫要同時完成任務。
問題是：部長為何要在疫情大流行依然下令敦睦艦隊出航，所有嚴部長所指出的四大缺失，對於航行在大洋中的軍官兵來說，根本對疫情的發展與新冠病毒最新變化認識全然跟不上，更何況官兵的軍事訓練根本沒有把「防疫如同作戰」 結合起來，才會出現在帛琉的活動裡根本沒有戴口罩，這不正反映出國軍在這次防疫作戰中並未全面戒備，海軍出包其來有自，只是身為三軍統帥的小英這次談話是道歉了！表示要調查改錯絕不護短。只是當這批年輕的海軍實習生有人痛哭擔心自己感染之後該怎麼辦？還得在受國人的指指點點與網路非議，……三軍統帥在下令國防與防疫要同時完成任務之際，是否還可以走進磐石艦正在集中治療與防疫的官兵們，協助他們重拾信心，成為更經得起考驗的新國軍呢？不能和國軍將士一起同甘共苦，這個三軍統帥不是喊假的嗎？
觀察多日來海軍出包事件，一直都沒有交代的核心問題：官兵在何時何地與傳染源接觸？沒有釐清這個關鍵問題，爭吵了半天都只是一場政治口水，無濟於事！
首先，若行程只有到帛琉，帛琉又是零確診，雖然官兵在三天停留活動中都未戴口罩，不過，迄今駐館與華僑與帛琉仍未傳出有感染案例的話，證明在3/15前敦睦艦隊都還無事。 （相關報導： 汪葛雷觀點：國防部長保蔡英文不保國軍，良心何在？ ｜ 更多文章 ）
其次， 三月中旬有五位海軍有求醫，這五人在檢疫中，被採檢有抗體，意味著他們感染了新冠病毒後，經治療後復原。艦上沒有報「發燒」，這是究責中最大的爭議之處。支隊長表示醫官給他的訊息五人中有一人住院兩天，他有回報給艦指部（國防部出示證據在發燒上填的是「0」，又說陳道輝坦承記錯了，紀錄上他只提到「扁桃腺發炎」）。檢查海軍的通報單，發燒欄位上寫的是「不明原因發燒（Fever of Unknown Origin、簡稱FUO）」依據醫官的專業，當時這五位的病況與感冒和暈船有關，所以並未當做是不明原因發燒來處理。國防部因這個數據是「0」而確認陳道輝有「匿報疫情」之嫌，這是有爭議的判決！
