台大醫院除了在1月30號成為全球第4個分離出武漢肺炎病毒株的國家以外，2月7號又再度分離出第2株，且發現這株與前一株不同，比較類似武漢剛開始分離的病毒株。而針對藥物治療的部分，台大副校長張上淳表示，經過相關申請程序，美國吉利德科學公司所研發的「瑞德西韋」藥物將可以用在重症病患身上。
台大團隊的病毒檢驗科前主任高全良和台大醫檢系教授張淑媛師徒，先後分離出台灣首個SARS和新型冠狀病毒株，而台大目前又順利分離第二株，且成功增殖病毒。張淑媛坦言工作壓力很大，但是有了病毒株才能開啟後續武漢肺炎相關研究，辛苦非常值得。
台大副校長張上淳15日表示，第一株發現的武漢肺炎病毒株，比較類似歐美等國的、散播比較廣泛的病毒株，目前已分析完成，在上周上傳到國際網站上。之後在第二個病人身上分離出另外一株病毒株，反而比較類似武漢剛開始分離的病毒株，此後便能繼續研究病毒和人體細胞的互動關係，並有機會開發出快速診斷的試劑，再進一步還可以測試哪些藥物對於這個病毒是有效的。而第二株病毒株在與國外的病毒株比較後，張上淳表示，將會猜想是不是更適應人體細胞，並分析是否有不同的傳播能力。
至於治療藥物的部分，張上淳提到，美國吉利德科學公司所研發的「瑞德西韋」藥物雖然還沒上市，可是經過相關的申請程序，還是可以用在病人身上。依據恩慈療法的原則，目前藥廠的策略並不是把藥物直接送到各個國家，而是在有適當需要使用的個案的時候向藥廠申請，就會免費提供、並快速寄送過來。 （相關報導： 武漢肺炎》台灣是全球第4個培養出新型冠狀病毒的國家！張上淳：有助快速診斷、發展新的治療模式 ｜ 更多文章 ）
而就台灣目前的病例看來，張上淳對於治療方法的說明是，輕症目前採用支持性療法就會好起來，至於中重度的狀況，則建議使用抗愛滋藥物加上干擾性治療，這也都是台灣本來就有的藥物。若屬重症病例，就需要向美國藥廠申請瑞德西韋來使用。
