馬英九訪陸祭祖行，是否受到符合規格的對待，其言行是否有守住前總統的尊嚴，在國內受到藍綠人士各自解讀，且褒貶不一。
馬英九深知此次大陸行必然受到各不同立場的人以顯微鏡、放大鏡來檢視其一言一行。因此費盡心思，在不致觸怒中共下做了巧妙的包裝。
馬英九到南京中山陵拜謁時說，一九一一年國父孫中山先生推翻滿清，建立亞洲第一個民主共和國—中華民國。「中華民國」這四個字從馬英九嘴裡蹦出來，相信許多人都嚇了一大跳。
在向孫中山銅像獻花時，花圈的署名是「中國國民黨前主席馬英九」，據了解該花圈是中方準備的，所以不可能出現「中華民國前總統」的稱呼可以理解。
而馬英九在揮毫題字寫下：「和平奮鬥、振興中華」幾個大字時，落款的日期寫「百一二，三，廿八」而非西元二O二三年，這也是打擦邊球，也是略觸中共底線的突破。
但是即令如此，還是有很多人不滿意的。質問為什麼不敢堂而皇之寫民國一百一十二年，卻掐頭僅寫「百一二」?可見馬英九實在很難為。
從歷史源流來看，孫中山先生建立中華民國是中共當局無法否認的歷史事實，中共保留辛亥革命的相關文物，也崇敬孫中山先生，等於承認有中華民國的過去。因此，馬英九如果有機會向中共大聲強調，中華民國是現在進行式，而不是過去式，就是此行最值得肯定的貢獻了。
凡事必須有因才會有果，未來的善果必須以現在良好的因作為基礎來建立。中共的目標當然是希望兩岸未來能統一，但兩岸的「現在」，是未統一的狀態，有分治的中華民國與中華人民共和國。如果將現在的中華民國完全否定掉，認為現在只有一個中國，那是從過去直接跳躍到未來，邏輯與法理皆不通，也是不可能成功的做法。因為既然承認過去，也追求未來，就不能否定現在。
以二次世界大戰後分裂的德國為例，統一前的東、西德，彼此是敵對狀態，但彼此之間並不否認對方，絕無像今天中國處處打壓台灣，不容許他國與台灣交往的情形。南北韓的情況也一樣，這與兩岸今天的情況有很大的差異。因此，兩岸之間唯有互相尊重彼此的現在，和平相處才有可能締造美好的未來。
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