台北地檢署指控，前總統馬英九擔任國民黨主席時涉嫌賤賣華夏三中股權（中視、中影、中廣），將他依《證券交易法》重罪起訴。據瞭解，檢方在高達七六○頁的起訴書中揭露的證據令人瞠目結舌。在一系列交易案中，馬對兩個買家著力最深，就是中時集團余建新與已故的長榮集團創辦人張榮發。
華夏三中淪余建新嘴上肉
在二○○一年底，扁政府試圖立法處理國民黨產，而○三年十二月二十四日修正公布的《廣電法》中更規定，政黨及其捐助的財團法人等應於○五年十二月二十六日退出媒體，否則可處警告、罰鍰、停播或吊照。時任國民黨主席的連戰決心清理黨產，打算出售華夏五中股權（中視、中廣、中影、中華日報、中央日報），當時有不少外資競逐。而跨足中天電視的中時集團余建新則把目光擺在中視，他找上國民黨前後任大掌櫃徐立德、張哲琛表達意願，卻遲遲沒下文。○四年八、九月間，梧桐亞太創投以七十七．五億元簽下華夏五中購買意願書，梧桐的操盤手董宋元正是連戰大兒子連勝文的好友，但隔年交易因故破局。○五年七月十六日，時任台北市長的馬英九當選國民黨主席後，余建新的契機終於到來。
檢方查出，張哲琛和汪海清當年八月分獲邀來到馬英九的台北市長辦公室，馬親自引薦兩人和余建新見面，當時金溥聰也在場。張哲琛說：「馬主席非常高興，因為有人願意買華夏，他指示我們好好跟余建新洽談。」眼看馬欽點余建新，中投立刻封殺眾多買家，只與余接洽。 （相關報導： 三中案簽結卻重啟調查 黃帝穎：不用新事證，檢方有疑慮就可重啟調查 ｜ 更多文章 ）
馬沾鍋，親自介入喬華夏股權案
馬英九要求在黨政軍條款大限前處理掉華夏，中投被迫與余建新匆促簽約，甚至沒拿到股款就把股權全部移交給他。隔年一月初，雙方開始談判交易細節，中投擔心拿不到錢，余則擔心當了中投的橡皮圖章會背負責任，要求在合約上加註財務架構，雙方爭執不斷。辦案人員發現，馬英九非常禮遇余建新。余能直接找張哲琛和馬英九洽談，○五年農曆年前，張哲琛赴美休假，余一透過律師李念祖發函到台北市長辦公室表示想解約，馬就緊張地打電話給汪海清，要他連絡張哲琛返台找余談判。馬還撥電話給李念祖表達繼續談判的意願。張哲琛兩天後就趕抵台灣見余建新，但余當場透過辦公室機要打給馬英九抱怨：「汪總（汪海清）又在幹嘛？拖啦？沒有誠意，想要賣給第三人。」就是這些抱怨讓馬英九數次打電話責罵張、汪。不過，即使余「直達天聽」，但他的交易條件仍讓中投望之卻步。在國民黨內部會議時，秘書長詹春柏擔心余「買空賣空」，馬卻對余很寬容，只裁示「再討論」。等到馬離開會場，張哲琛就說：「他就是壓英九啊！」蔡正元補一槍：「他就是吃定你想選總統嘛！」檢方發現，馬不斷介入協調是擔心影響公信力。他曾在會議上說：「我基本上還是希望不要破局……講好簽約了，最後公布破局，我覺得公信力……會排山倒海，以後你講的話沒人會相信……如果情況緊急，我就直接打電話給他（余建新），要不然我約他在哪邊或是直接見面……如果碰到一些困難……不妨提到我……。」但馬也曾撂話：「我覺得我們不能受人家威脅……動不動就說你們二○○八年要選總統，所以我們就不敢怎麼樣……與其被卡在這個地方脅迫，還不如大家就明著來做了……。」
