針對診所協助施打疫苗掛號費補助議題，台灣民眾黨批評蔡政府「請客好意思叫診所買單」，並點名衛福部長陳時中要說話算話。民眾黨表示，政府片面宣布取消掛號費，其實是在壓垮基層診所；且衛福部還拖欠基層2個多月的行政補助費，導致不少診所因此陷入營業困難，甚至歇業。
民眾黨10日在臉書指出，全民打疫苗免費是一場「大內宣」，惠民政策竟是用壓榨基層醫護換來的，疫情爆發以來，指揮中心一再拖欠前線醫護的糧餉；這次同樣在鬧上新聞版面後，才表示9月10日前會撥付欠款給基層診所。民眾黨批評，陳時中不能只會推託，要基層醫護做功德。
民眾黨質疑，為了配合疫苗施打，基層醫療院所增加許多人力及物力成本，政府卻未經協商，片面宣布診所不得收取施打疫苗掛號費，改以疫苗處置費和行政補助費來補貼診所，卻又拖欠撥款，讓診所面臨現金流吃緊的困境，光今年5至7月全國就有208家診所歇業、停業。
另外，針對疫苗施打預算，民眾黨指出，北市6月率先喊出施打疫苗免費，掛號費、雜費等費用由市府編列預算吸收，未料指揮中心這時才稱已編列40億預算讓全民免費打疫苗，綠營網軍更藉此指責北市府收割。然而，中央的免費支票原未列在特別預算中，導致衛福部需要另覓財源來補貼，才會出現拖欠基層診所行政費的荒謬情況。
民眾黨說，如今真相終於大白，原來全民免費打疫苗的政策，只是中央為了不讓台北市專美於前，而急就章推出，事前毫無考量預算是否足夠，「這樣失信、失能的政府，又要如何帶領台灣打贏抗疫戰？」
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