為了把關食品安全，政府從3年前就開始建置食品雲，將食品資料履歷上傳，以利追溯追蹤。食品雲分3階段進行，原本今年7月應該由衛福部接手第3階段，健全所有食品工業上、下游資料登錄，但衛福部以尚未準備好為由，遲未接手食品雲的建置作業。官員說，食安問題層出不窮，食品雲建置必須加快腳步，否則恐怕會再出問題。
食品雲建置的3階段分別是第1階段由經濟部技術處進行「安心食品履歷追溯雲端運用計畫」，第2階段由農委會接手，展開「食品追溯雲端服務建置及推廣計畫」，第3階段則規劃由衛福部於今年7月接棒，希望完成所有食品工業品項上傳登錄。今年6月農委會已結束第2階段，完成新北市、台中市團膳系統導入，接下來要由衛福部接手，於2016年完成全台5648所學校團膳導入。
對於為何食品雲以計畫方式呈現，而非編列年度預算列入施政項目，政院官員說，2011年3月發生塑化劑事件，引發政府對食安重視，決定立即仿效歐盟國家，建立食品雲追溯追蹤機制，但是當年度預算是前一年編列，加上當時只是試行，還不知道可以做到甚麼程度，因此以計畫方式向科發基金申請預算，於當年9月開始實施「安心食品履歷追溯雲端運用計畫」。
行政院政委蔣丙煌表示，政府推動食品雲，希望大中小規模的食品業者，都必須從上游原料到製成產品的下游供應商，建立追溯體系，從上一手到下一手的資料全部上傳雲端，不過，食品雲上面的資料並非全面公開，有關業者的商業機密，例如供應商系統等，就會加密不公開，食品業大可安心。
農委會資訊中心主任潘國才說，「食品追溯雲端服務建置及推廣計畫」主要是完成農產品源頭追溯系統，將農民生產的產品、農業合作社品項納入食品雲等階段性任務；最明顯的功能是建構學校團膳系統，新北市、台中市中小學已導入系統，學校營養午餐若發生問題，很快可知食材哪採購？比如這次劣質豬油事件發生後，新北市教育局很快就通知各學校哪些食材有問題、不能用。
對於如何才能做到直接在源頭預防，避免類似劣質豬油的食安事件再發生，潘國才表示，食品雲建構完成後，必須要有大量的資料，「至少要有80%到90%的完整資料」上傳到食品雲，並建立規則，透過程式設計的分析，可以在最初就辨別哪些東西不能到哪裡去，比如皮革油不能賣到食品業者那邊去，萬一發生這種情況，系統就會自動發出「警示」。
由於衛福部遲未準備好，在農委會完成第2階段後，暫時由科技會報督導食品雲相關業務的推動。科技會報於7月委託中衛中心進行「食品追溯雲端服務建置及推廣計畫」，銜接農委會之前建置的系統，於9月初完成5都5縣市中小學團膳系統導入，預定明年2月底導入全台22縣市中小學團膳系統，2016年增加完成全台5648家中小學、高中職、幼兒園團膳上雲，
科技會報執行秘書鐘嘉德表示，該項計畫除了要完成建構所有的學校團膳食品雲，也將強化已加入食品雲系統的150家食品加工業的品項登錄，「過去是由業者自願登錄，比如味全、頂新都沒有將所有產品品項登錄，未來要求業者登錄所有品項，積極追溯追蹤」，幫助業者自主管理。而為有效追訴追蹤和勾稽管理，考慮修改食品安全衛生管理法第八條，增列第3項，強制業者上傳產品資料履歷，此外也將從油品業者開始，逐步要求食品業者一律使用電子發票。
