前陸委會特任副主委張顯耀遭去職引發政治風暴，國安系統人士表示，從陸委會處理的方式來看，張顯耀去職內情不單純，應該和緋聞無關；外傳總統府收到檢舉已調查一段時間，「可能張顯耀的解釋上面無法接受」，但張顯耀以聲明方式公開自己被請辭，顯見高層和張對於被檢舉內容認知有差距。
張顯耀17日晚間發出聲明，指所謂「請辭」係為「被長官告知辭職」，陸委會稍晚以新聞稿回擊，指張顯耀是因為「工作上有疑點」，必須調離現職接受調查。不過，陸委會並未說明「工作疑點」為何，而張顯耀接受的是廉政或其他哪一類調查。國安人士研判，檢舉內容應無關緋聞，「金錢最有可能」。
該人士說，政務官調職和事務官不同，事務官若遇到檢舉通常會調非主管職或參事職，等待司法或內部程序決定；但政務官遭檢舉時則沒固定作法，可能立即展開司法程序，政治上決定是否要求他離職，或先暫停職務，若非司法問題，而是內部程序或與長官相處問題，需一段時間處理，通常會找個好的方式解決。
該人士指出，陸委會是對張顯耀進行行政調查，因此不是內部程序的問題，而是因遭檢舉而進行司法程序，政務官涉及司法調查可以先請他離職，根據張顯耀自己的說法，「14日被長官告知辭職」；長官應該有告知要張辭職原因，但可能張的解釋「上面無法接受」，因此行政院在16日逕行以新聞稿宣布張去職。
外界揣測張顯耀和王郁琦不和是去職原因，黨政人士認為不可能。該人士表示，張顯耀和王郁琦搭配得很不錯，「應該沒有不和」；張顯耀擔任陸委會副主委以來，任事相當積極，與王郁琦內外互補，互動不錯。他說，應該是調查有眉目，高層認為必須讓張去職，用「家庭因素」是想保護張，但沒想到張反擊。
