行政院近期推動重大法案、政策時，與立委進行溝通是否順暢，成為外界關注焦點。有一政院官員分析，面對各種議題，行政院還是絕對尊重立法院的權利，並且進行各種溝通協調，不會讓立委有「什麼都要用坦克車，直接壓過去」的感覺，要請大家放心。
在近期推動政策時，包括行政院要推動的組織改造、數位身分證（New eID）、「國家重點領域產學合作及人才培育創新條例」等議題，都讓立委在內部討論時，有不少意見。對此，有一黨政人士指出，這都是內部溝通的過程，行政院對於各樣議題不會是鐵板一塊，更不是沒有任何修改的空間，外界不用做過多的解讀。
遭立委質疑故宮併文化部太晚提 政院官員：不會強推政院版
舉例來說，就組改的部分，有立委在內部討論時，就未來環資部要主責的流域管理提出意見，也有立委認為，行政部門太晚告知要將「故宮併入文化部」一案。有一政院官員說明，其實有不少中南部立委提出的意見，也是反應選民的心聲，相關意見都可以進行討論，若是有需要修改的地方，相信行政院也都會進行修正，不會強推院版。該人士強調，組改最早是馬政府時期要推動，但是始終沒有辦法完成，直到現在也是要處理過去就留下來的問題。
至於「故宮併入文化部」一事，上述官員說明，其實過去文化部長李永得在黨團內部，還有行政官員也有向黨籍立委說明數次，而對於此案，黨內立委並沒有什麼反對、不滿的意見，但確實有看到國民黨操作故宮改名的議題，引起社會一些討論。該人士指出，故宮從來就沒有要改名，至於「故宮併入文化部」的議題，也沒有一定要改，都還可以討論。
現在數位身分證剩下「新竹市」試而已
對於近期有不少人權團體，甚至執政黨內也有綠委對於數位身分證（New eID）的議題表達反對的意見，甚至相關預算還在立法院的委員會審查時被凍結一半、4億元。有一行政院官員指出，當時最早提出來的是還在擔任行政院副院長的張善政，後來到了賴清德擔任閣揆時，也有指示時任國發會主委陳美伶進行研議、推動，後來到蘇貞昌擔任院長時期，確實也認為世界上有不少國家都已經數位化，在控管完善、建構國家數位化的願景下，有進行拍板。
不過，在引發各界疑慮後，上述人士指出，當然外界對於資安、人權等價值有不同的看法，行政院也不會蠻幹，甚至立委凍結的預算，也不會要求協助解凍，甚至就目前來說，過去從原本已經準備要全面換發，改為7縣市小幅試辦，再到明年1月時僅有新竹市試辦，甚至民眾還能自行選擇，就都是在進行調整，政策不是不能討論、變動。
至於「國家重點領域產學合作及人才培育創新條例」的部分，有一政院人士說明，確實在內部討論時，立委有提出不少意見，但後來相關部會也都有進行修正後，才經過行政院送出，並沒有都是依照行政院的內容通過。
該人士也說，面對各種法案、政策，行政院絕對都是盼與立委盡量溝通，並且尊重立法院的職權，甚至如果經過溝通後，立法院對於行政院的版本不滿意，在委員會、院會討論時，都還是可以進行修正的，還是有很多空間。
