「叔叔說，你自己做選擇，Nylon（鄭南榕）問你要不要過去幫忙……我頭搔搔，什麼叫辦雜誌？後來他跟我說就是出版雜誌，我想很好玩，就說好。」那時邱謙城完全不曉得辦雜誌是怎麼一回事、更不曉得在戒嚴時期辦黨外雜誌多辛苦，就這樣一投栽進去《自由時代》。
邱謙城身為《自由時代》最資深員工之一，一開始幾乎不懂政治，最初的工作就是幫忙找辦公室、把一切安頓好。他記得當時要租辦公室、跟房東表明來意說要辦黨外，房東竟爽快答應：「你去用啊，我這邊也是空著！」接著就開始準備辦公傢俱，去買中古櫃子桌子自行上漆整理，接著又把鄭南榕昔日在立法院以助理名義深潛多年、蒐集的照片名片都一一整理建檔，邱謙城開始記政要人名、背電話號碼，一步步開始。
從鄭南榕在辦公室存放的書籍資料，邱謙城也一步步了解台灣經歷的各種政治發展與影響，知悉國民黨統治台灣的各種不當行為、二二八屠殺與白色恐怖──童年時期對各種黨國社會氛圍的異樣感、青少年時期看著黨外選舉與美麗島事件被啟發、第一份工作菜鳥時期又見識台灣過去不為人知的殘酷歷史，這時的邱謙城已註定與抗爭結緣，從1984到1989年，邱謙城就這樣投入最禁忌的黨外雜誌產業、開始與警總搏鬥、只為發出一份雜誌的生活。
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「警總，就是台灣警備總司令部，你們現在年輕人有聽過這個嗎？」警總，這詞彙似乎已經是上上個世紀的事了，邱謙城怕眼前1990年後才出生的年輕記者不知道，還一度貼心地打算做名詞解釋。如今年輕人即便聽過名字也深感遙遠的警總，當年是如影隨形，黏著於《自由時代》的每個職員身邊。
邱謙城說，戒嚴時期所有雜誌都受〈台灣地區戒嚴時期出版物管制辦法〉控制，雖然在美麗島事件後，當局基於國際壓力看似有「開放」一些黨外雜誌，實際上仍用法律作為控管言論的利器，對內容看不順眼就查禁或停刊，而當時可謂「最激進」的《自由時代》，自然是警總頭號目標。
「那時候也不知道什麼叫『最激進』，後來才知道，我們最有實力。」邱謙城說，在當年諸多黨外雜誌，《自由時代》是擁有最多內幕跟獨家報導的、甚至包括對黨外消息，還曾報導過1986年長榮付錢給桃園議員希望變更南崁交流道地目蓋貨櫃場、黨外人士兼當時台北市議員張德銘（後為民進黨創黨中執委）居中牽線一事，張德銘因此控告鄭南榕違反《公職人員選舉罷免法》意圖使人不當選，致鄭南榕遭判刑8個月。
