針對「一國兩制」，李登輝指出「大陸對港澳所承諾的『一國兩制』模式，對臺灣並無絲毫的吸引力。主要原因是『一國兩制』互相矛盾，違反民主的基本原則，又否定中華民國的存在。大陸雖想將『一國兩制』的港澳模式套用於我方，但臺灣不是港澳，港澳原為殖民地，中華民國是主權獨立的國家，兩者有根本的不同。」總統府在發表該訪問時還特別強調：「這是一個法律事實的陳述，我國的大陸政策並沒有改變。」
當時的副總統連戰也表示：「我們提出『特殊國與國關係論』的主張是基於維護國家尊嚴、保障人民權益的考量。也是表達臺灣兩千三百萬人民的心聲。這是攸關國家發展大是大非的課題。…因此李總統提出『特殊國與國關係論』的明確主張，就是要突破兩岸間現存不合理的框架。」
1999年8月10日，李登輝公開表示「在卸任前提出國家定位後，以後不管是誰做總統，都會很好做事情。」他又重申「大陸政治民主化，經濟自由化後，就是國家統一的最重要方向。」李登輝「特殊的國與國關係論」是一種具有歷史觀的主張，而蔡英文總統雙十演說也呼籲中華人民共和國正視中華民國存在的事實，李登輝與蔡英文的這些主張同兩蔣堅持的「中華民國主權獨立」是一脈相承的。
＊作者為牛津大學國際關係學博士
