急診醫學會日前爆出醫師人力出現斷崖式流失，事實上，神經外科、心臟外科等高壓科別也有類似的問題。為留住醫院醫師人力，總統賴清德成立的健康台灣委員會指出，衛福部應針對醫師加班費給予所得稅節稅議題進行討論，衛福部健保署今（11）日首度召開會議，與會人員對醫師加班費節稅多有共識，惟是否需要設定加班延長工時占率上限，或採核實方式，只要是加班費都列入，有待進一步討論。
台灣醫務管理學會理事長、新光醫院副院長洪子仁表示，近日醫院急難重醫師人力不足，年輕醫師不願意投入急難重科別，醫學院的學生甚至有「一皮、二眼、三耳鼻」的順口溜，即成績愈好的學生愈偏好選擇較能兼顧生活品質五官科。另外，大醫院急重難罕醫師有些人到一定年紀，也不想這樣繼續操下去，紛紛流向診所，這背後反應出的醫師結構性問題，與不合理的稅負制度密切相關。
洪子仁說，現行制度下，醫院主治醫師幾乎全數收入都被列為薪資所得，最高稅率可達40%；反觀診所醫師則可以扣除營運成本後再課稅，稅負差異明顯，導致人才離開醫院體系。且醫院主治醫師長年承擔夜間值班、創傷重大手術與急重難罕症照護，平均每周工時高達70至100小時，遠超過一般受薪階級職工，但其「加班費」卻與薪資一併課稅，無法反映超時勞動的特殊性貢獻。
今天會議對於如何計算醫師加班費給予節稅提出許多版本，洪子仁指出，包括以醫師每月加班時數100小時為上限，如主治醫師年收入約有17萬至36萬元免稅，節省稅率約6%至12％，預估每年稅收約少30億元，但部分急重症科別每月加班時數遠超過100小時，容易出現不公平；因此有人提案以加班時數一定比率作為上限，因為如果沒有上限，容易出現浮濫申請問題。
洪子仁認為，依勞基法規定，勞工一周工時為40小時，一個月約4周為160小時，另加班節稅上限為46小時，占比約近30%，若為體諒醫師辛勞，加班及值班時數上限占總工時不應低於50%，以多增加誘因，減少醫院醫師往基層醫療流動的速度。另為了避免加班費浮報，希望明確規範加班費計算項目，包括夜間門診、假日看診、急診手術、假日巡房、災害期間出勤、醫院評鑑會議等，確保符合實際醫療現場需求。
洪子仁強調，必須面對當照顧急重症的醫師一個個離開醫院，最終受到影響的，是整體醫療體系，更是每一位病人。因此，肯定政府正視這項長年未解的不公制度，給予醫師一個合理的工作環境，給台灣社會一個可長可久的健康保障。
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