為悼念30日在家輕生的反黑箱課綱發言人林姓學生，學生晚間在教育部前聚集，但在晚間9點50分左右突然衝入立法院前廣場靜坐，要求立院應召開臨時會，立委連署阻止課綱上路、吳思華下台，之後再翻出圍牆回到教育部，要求在31日凌晨1點前，要求教育部長吳思華下台，然而時限到時並未獲得回應，凌晨1點50分，聚集約上千名民眾與學生，部份轉往教育部側門，由於該處僅約十餘名警力，民眾趁勢翻牆而入，最後正面學生也突圍，再度攻入教育部。
現場學生給吳思華請辭的最後期限截止，凌晨1時10分，現場學生召集人表示行動延後，聚集商討對策準備鋼剪，剪破鐵網、拒馬，突圍後衝進缺口，加上突破側門的民眾裡應外合，愈來愈多學生湧入教育部門前廣場，大喊「吳思華下台、撤銷課綱」，與警方對峙。有年輕女學生在突圍行動後左大腿受傷，包紮後坐上擔架，由醫療人員照顧運出抗議現場，也有學生遭拒馬割傷，血流不止。
反課綱學生表示，他們有默契，不會攻入建築物，但警方若持續挑釁，將有進一步動作，呼籲警方注意言行。新增警力欲從教育部西側進入，但群眾隨即自門前廣場前往支援，以優勢人力阻擋警方增援。
民進黨立委柯建銘、陳其邁、段宜康及台聯立委賴振昌在30日深夜到教育部前向學生致意，強調黨團支持提案召開臨時會，廢止黑箱課綱，並要求教育部長吳思華下台負責。民進黨主席蔡英文31日也將對黑箱課綱議題，返回臺北召開黨及黨團幹部會議，原定行程全數取消。學生也對教育部長吳思華表達不滿，怒吼「殺人兇手、黨國打手吳思華」，並撒出冥紙。
30日晚間10時15分時，中正一分局長張奇文出面，就被媒體與學生圍住，才要開口向群眾喊話，就被學生鼓譟阻斷，還有學生撒冥紙，現場一度緊張，幸無激烈與警方衝突。
