教育部「高等教育深耕計畫」（簡稱高教深耕計畫）於2017年7月，接續「獎勵大學教學卓越」、「邁向頂尖大學」、「發展典範科大」等計畫登場，與這些計畫單一標的性質不同的，高教深耕計畫幾乎涵蓋高等教育所有面向，且一如往常地，引導著國內大學校院的辦學。
該計畫第一期的五年在2022年結束後，於2023年進入第二期的五年，現在到了第二年，利害關係人（stakeholder）應該逐漸關切該計畫是否能達成其所揭櫫的「提升大學品質及促進高教多元發展」和「協助大學追求國際一流地位及發展研究中心」的任務。
根據教育部的英文網頁（2023.12.19），高教深耕計畫的英譯版顯示為「Higher Education Sprout Project :Sustained progress and rise of universities in Taiwan」，中文直譯為「高等教育萌芽計畫：臺灣（的）大學之持續進步和提升」，把副標題每個英文單字第一個字母擷取出來，拼成「SPROUT」（萌芽）。在教育部「Education in Taiwan 2019-2020」年報高等教育篇中也是用同樣的表現方式，但副標題變成主標題，沒有高等教育字樣，成為「Sustained Progress and Rise of Universities in Taiwan（the SPROUT Project）」，直譯為「臺灣（的）大學之持續進步和提升（萌芽計畫）」。
將臺灣高教深耕計畫訴求的「持續進步和提升」的英文字首擷取出來，拼成計畫名稱的英文版，並無不可，國內外亦常見某種方案名稱，用其各個英文單字字首拼成另一個單字的文字手法，如雙語教學模式的「FERTILE」（沃土模式）。但高教深耕計畫英文版，運用藏頭字母拼字轉譯的結果，計畫中關鍵字中文「深耕」，英文變成了「萌芽」。同一個計畫出現了中英文差異很大的版本。
深耕變萌芽不僅是名稱不同，含意也有差異。在農耕操作上，應為先翻土深耕，然後播下種子，然後等待種子萌芽。根據《教育部辭典簡編本》解釋，「深耕」謂之「為有利於作物生長，而作深約20公分以上的翻耕土壤工作」；「萌芽」謂之「草木初生，比喻事物開始進行、活動」（2021）。顯然在農序上和語意上，是深耕在前，萌芽在後。 （相關報導： 點教育》只說教學策略而不重視課程設計，課綱如何成功！ ｜ 更多文章 ）
再從高教深耕計畫的重要子計畫「大學社會責任實踐計畫（University Social Responsibility）」（簡稱USR計畫）探究，教育部指出，高教深耕計畫第一期裡的USR計畫第一期（2018-2019），分成「種子型、萌芽型、深耕型」；USR計畫第二期（2020-2022），分成大學特色和國際連結兩類，每類下再分成「萌芽型」和「深耕型」；USR計畫第三期（2023-2024）則屬於高教深耕計畫第二期，分成大學特色和永續發展兩類，大學特色類之下分成「萌芽型」和「深耕型」。另依據教育部「USR計畫Q＆A」，USR計畫區分為種子型計畫（A類）、萌芽型計畫（B類）、深耕型計畫（C類），種子型計畫內容屬於「問題界定和概念發想階段」，萌芽型計畫內容屬於「問題解決方案試行、概念驗證及發展階段」，深耕型計畫內容屬於「規模擴大和模式推廣階段」。故包括在高教深耕計畫中的USR計畫，其進程順序為種子→萌芽→深耕。顯而易見，深耕階段的內容當較萌芽階段來得深入且廣泛，代表著整個計畫的統整和跨領域功能運作已臻成熟。
